Vaatamata anekdootlikele väidetele vastupidise kohta, on tõeline šokolaadiallergia nii haruldane, et seda peetakse meditsiinilises mõttes praktiliselt olematuks. Kakaooad, šokolaadi peamine koostisosa, ei ole tavaliselt süüdlased, kui pärast šokolaadi tarbimist märgatakse toiduallergia sümptomeid. Kõik kõrvaltoimed on tavaliselt põhjustatud mõnest muust šokolaadi koostisosast ja see ei ole konkreetselt šokolaadiallergia.
Šokolaaditooted sisaldavad sageli muid koostisosi, mille suhtes paljud inimesed võivad olla allergilised. Peaaegu kõik šokolaaditooted sisaldavad piimatooteid, näiteks piima, ja piimaallergia on üsna tavaline, eriti väikelastel. Inimestele, kellel on laktoositalumatus, kuid kes taluvad väga väikeseid piimakoguseid, võib valikuks olla mõrkjas-magus, poolmagus ja tume šokolaad. Nendel šokolaaditoodetel peab olema suurem šokolaadivedeliku kontsentratsioon ja seega peab see sisaldama väiksemat piimaprotsenti kui kerge või piimašokolaad. Väga tundliku laktoositalumatusega inimestele on turul saadaval ka mitut marki piimavaba šokolaadi.
Maapähklid ja pähklid, nagu mandlid, kreeka pähklid ja pekanipähklid, võivad samuti olla šokolaaditoodete allergilise reaktsiooni allikaks. Paljud kommid ja muud šokolaaditooted sisaldavad pähkleid, kuid isegi need, mis seda ei sisalda, võivad siiski osutuda problemaatiliseks. Mõned šokolaaditootjad valmistavad oma maiustusi samadel tootmisliinidel, kasutades samu vaatisid ja masinaid, olenemata sellest, kas lõpptootes on pähkleid või mitte. Seetõttu võivad isegi šokolaadid, mis ei sisalda pähkleid, sisaldada vähesel määral pähkliliha või õlisid.
Neil inimestel, kes on pähklite suhtes ülitundlikud, eriti neil, kellel on tõsine maapähkliallergia, võivad isegi need väikesed pähklitoodete jäljed põhjustada märkimisväärset reaktsiooni. Sellised isikud peaksid tutvuma etiketiga ja kui pähklivaba tootmist pole mainitud, tuleks ühendust võtta tootjaga. Olemas on mitu pähklivaba šokolaadi tootjat, näiteks Nothin’ Nutty® ja Vermont Nut-Free®.
Maisi sisaldus šokolaadis võib tundlikel inimestel põhjustada allergilist reaktsiooni, mida võidakse valesti tõlgendada kui šokolaadiallergiat. Kõrge fruktoosisisaldusega maisisiirupit kasutatakse paljudes šokolaadikommide kaubamärkides. Nagu pähklite puhul, toodavad paljud tootjad šokolaadi, mis ei sisalda maisi, samadel tootmisliinidel kui tooted, mis seda sisaldavad. Ristsaastumist on peaaegu võimatu vältida ja isegi väikesed maisikogused võivad ohustada väga tundlikke inimesi.
Teine oletatava šokolaadiallergia võimalik süüdlane on soja. Šokolaad on emulsioon – kahe vedeliku segu, mis tavaliselt eralduvad. Selleks, et vältida komponentide eraldumist ja hoida šokolaadi tahkel kujul toatemperatuuril, lisatakse tavaliselt emulgaator. Levinuim šokolaaditoodetes kasutatav emulgaator on sojaletsitiin. See lisand võib olla problemaatiline inimestele, kellel on sojaallergia.
Marjad on populaarsed šokolaadikarbi täiteained ja on ka üks tugevamalt allergeensemaid toite. Marjaallergiaga inimestel oleks mõistlik vältida šokolaadisortimente, et minimeerida võimalikku kokkupuudet. Kofeiin võib tekitada probleeme ka neile, kes on selle kemikaali suhtes tundlikud. Kuigi kofeiini leidub šokolaadis suhteliselt väikestes kogustes, võib see siiski olla piisavalt allergilistel inimestel. Oluline on märkida, et mida tumedam on šokolaad, seda suurem on kofeiinisisaldus.
Nisu- või gluteeniallergiaga (nt tsöliaakiaga) inimesed peaksid enne mis tahes šokolaaditoote tarbimist jälgima etiketti. Kreemitäidisega šokolaadides kasutatakse sideainena sageli nisutärklist või -jahu. Turul on gluteenivabu šokolaadikompvekid, mida pakuvad sellised ettevõtted nagu Endangered Species Chocolate.
Väga harvadel juhtudel võib šokolaaditoodete tarbimine põhjustada allergilisi sümptomeid isikutel, kes võtavad retseptiravimit Prozac® või teisi serotoniini tagasihaarde inhibiitoreid (SSRI-sid). Šokolaad võib põhjustada teatud neurotransmitterite, sealhulgas serotoniini vabanemist. Prozac® ja teised SSRI-d mõjutavad ka serotoniini taset ajus. Koos šokolaadiga võib see põhjustada ravimite koostoimet.
Toiduallergia võib ilmneda igal ajal. Šokolaadiallergia või mõne muu toiduallergia kahtluse korral tuleb konsulteerida arstiga. Kui sümptomid on rasked, sealhulgas äkiline lööve, kiire pulss või hingamisraskused, tuleb pöörduda kiirabi poole. Raviarsti või allergoloogi tuleks teavitada sellest, millist toodet täpselt tarbiti ja kas tegemist on retsepti- või käsimüügiravimitega.