Jaapani magustoidud võivad olla traditsioonilised, kasutades kohalikke puuvilju, taimi ja pähkleid, välismaist importi või nende kahe ainulaadset kombinatsiooni. Jaapani magustoitudest on palju piirkondlikke variatsioone, mida tuntakse meibutsuna, ja turistidele mõeldud suveniiride (omiyage) versioone. Traditsioonilistes Jaapani magustoitudes kasutatakse selliseid koostisosi nagu magusad azuki oad, puuviljad, pähklid ja mochi.
Mochi on kleepuv kleepuv riisikook, mis on Jaapani maiustuste keskne element. Seda serveeritakse sageli maiustuste ümber, nagu azuki pasta (daifuku), anko ja maasikapasta. Mõned magustoidud maitsestavad mochi selliste maitsetega nagu kirsiõis (sakura), virsik ja roheline tee. Mochi on kõige populaarsem uusaastapäeval.
Wagashi on mochi-põhine magustoit. Ei ole ühte tüüpi wagashit, vaid selle asemel on kümneid variatsioone. Nende valmistamiseks kasutatakse puuvilju, pähkleid, azuki ja mochi. Rohelist teed serveeritakse sageli magusate magustoitude lisandina.
Mochist valmistatakse ka Jaapani magustoite nimega dango. Dango on mochi pallid, mis pannakse vardasse ja kastetakse maitseainesse. Traditsiooniline festivali dango kastetakse sojakastmesiirupisse nimega shouyu ja seda nimetatakse mitarashi dangoks. Teine dango tüüp on bocchan dango, millel on üks tavaline dango pall, üks rohelise tee maitseline pall ja üks azuki maitsega pall.
Mochi saab valmistada erineval viisil, et valmistada želeed. On ka teisi tarretisi, mida nimetatakse agarželeedeks, mida kasutatakse magustoitudes, nagu anmitsu ja mitsumame. Need tarretisekuubikud on kombineeritud selliste koostisosadega nagu azuki või anko, puuviljaviilud ja mitsusiirup.
Paljud Jaapani magustoidud on välismaise impordi keerdkäik. Näiteks castella on kook, mis on oma nime saanud Hispaania Kastiilia piirkonnast, kuid tegelikult on see jaapani versioon Portugali koogist, mida tuntakse Pao-de-lo nime all. Castella on rullbiskviidi kook, mida süüakse sageli iseseisvalt või pruuni suhkru, rohelise tee pulbri või maitsestatud tuhksuhkru/glasuuriga.
Jäätis on ka Jaapanis populaarne magustoit. Sageli serveeritakse azuki ubade ja mochi kõrvale ühte vanilje- ja teist rohelise tee jäätist. Saadaval on ka mitmesuguseid mochi-mähisega jäätiseid, mis on valmistatud vanilje-, šokolaadi- või rohelise tee jäätise ümber või maitsestatud mochiga tavalise jäätise ümber.
Paljud Jaapani välismaised magustoidud on läbinud rohelise tee protsessi. See tähendab ühe koostisosa asendamist rohelise teega. Näiteks on palju rohelise tee maitsega šokolaaditahvleid. Samuti on saadaval rohelise tee castella koogid ja muud käsnad, rohelise tee jäätis, juustukoogid ja tiramisu. Sarnaseid versioone on tehtud ka kirsiõie maitsega.
Jaapanis on ka mitmeid magusaid leibasid, mida saab serveerida magustoiduna. Melonpann näeb välja nagu melon, kuid on valmistatud tavalisest leivataignast, mis on enne küpsetamist küpsisetainasse keeratud. Neid võib serveerida tavalisel kujul, šokolaaditükkide sees, vanillikreemitäidisega või maitsestada selliste koostisosadega nagu rohelise tee pulber ja karamell. Anpan on magus leib, mis on täidetud azuki ubadega.