Kõhunäärmes toodetud ensüümid vastutavad suures osas seedimisprotsessi eest ning kõhunäärme mahlades erituvad kolm peamist pankrease seedeensüümi. Proteaasid alustavad seedimisprotsesse. Tarbitavad rasvad tuleb lagundada mitmes etapis ja selle protsessi eest vastutavat pankrease seedeensüümi nimetatakse pankrease lipaasiks. Samamoodi tuleb tärklised ja süsivesikud lagundada ning seda teeb amülaas.
Proteaase on kahte erinevat tüüpi, trüpsiin ja kümotrüpsiin. Need kaks pankrease seedeensüümi töötavad koos ja maos asuvate pepsiinide abil vastutavad seedimisprotsessi käivitamise eest. Pärast nende teket kõhunäärmes muudetakse need mitteaktiivseteks vormideks, mida nimetatakse trüpsinogeeniks ja kümotrüpsinogeeniks, mis seejärel vabanevad peensoolde. Seal muutub trüpsinogeen trüpsiiniks, kui see puutub kokku soolestiku ensüümi enterokinaasiga. Trüpsiin omakorda aktiveerib kümotrüpsinogeeni ja muudab selle tagasi aktiivseks vormiks.
Pankrease lipaas on pankrease seedeensüüm, mis vastutab rasvade triglütseriidide molekulide lagunemise eest kaheks monoglütseriidiks ja kaheks vabaks rasvhappeks, mida keha saab edasi töödelda. Kuna pankrease lipaas ei suuda keemilist reaktsiooni üksi läbi viia, sõltub see protsessi abistamiseks maksas oleva sapi olemasolust. Üks ensüüme, mis viiakse soolestikku kõhunäärmemahlade osana, aitab kaasa rasvade imendumisele kehas.
Amülaas on üks pankrease seedeensüüme, mida ei tooda ainult kõhunääre. Esineb ka süljes, veres ja uriinis ning lagundab tärklises olevad ühendid kasutatavaks komponendiks. Amülaasi tüüpe on mitut tüüpi ja iga tüüp lagundab tärklisi oma struktuuri eri punktides. Pankrease toodetud amülaasi nimetatakse alfa-amülaasiks, et eristada seda teistest tüüpidest.
See seedeensüüm täidab kehas teist funktsiooni – aitab diagnoosida pankrease kahjustusi või haigusi. Väikestes kogustes veres ja uriinis esinev amülaasi kõrge tase mõlemas vedelikus võib viidata sellistele haigustele nagu pankreatiit või süljenäärmete põletik. Samamoodi võivad lipaasi vereanalüüsid diagnoosida ka pankreatiiti, kuid võivad paljastada ka selliste haiguste tunnuseid nagu tsüstiline fibroos, Crohni tõbi ja tsöliaakia. Kaasaegne meditsiin on avastanud pankrease seedeensüümidele uued ja usaldusväärsed kasutusvõimalused.
Kõhunäärme sekretsioonid on olulised ka seedesüsteemi tasakaalu säilitamiseks. Bikarbonaat on alus, mis eritub peensoolde ja neutraliseerib soolestikku lekkivat maohapet. Sarnaselt teistele pankrease seedeensüümidele tekib vesinikkarbonaat pankrease eksokriinrakkudes, mis eritavad ka hormoone nagu insuliin ja glükagoon.