Mükotoksiinid on mürgised ained, mida toodavad seened tavaliselt sekundaarsete ainevahetusproduktidena. Need toksiinid pakuvad inimestele suurt huvi, kuna need võivad inimestel põhjustada haigusi või isegi surma, kuid neid saab ka mitmel viisil kasutada. Mõned Penicillium hallitusseened toodavad näiteks mükotoksiine, mis on bakteritele kahjulikud. Mükotoksiinide uurimine on laboris edenenud hüppeliselt alates 20. sajandi keskpaigast, mil inimesed hakkasid mõistma mükotoksiinide ulatust keskkonnas.
Toksiinide tootmine pole looduses haruldane. Paljud organismid muudavad toksiinid end vähem atraktiivseks, tagades, et nad elavad oma geneetilise materjali edasikandmiseni, mitte ei söö neid. Muudel juhtudel on toksiin organismi ainevahetuse puhtjuhuslik kõrvalsaadus. Seened tekitavad kogemata mõningaid toksiine aminohapete loomise protsessis, mida nad söödavate materjalide seedimiseks kasutavad. Mõnevõrra ebatavaliselt seedivad seened asju enne söömist, vabastades aminohapped orgaanilisele ainele, et see enne tarbimist lagundada.
Mürgised seened on inimeste seas kuulsad oma mükotoksiinide poolest. Paljud seened sisaldavad ühendeid, mis põhjustavad seedetrakti vaevusi, kuid mõnedel on ohtlikumad toksiinid, nagu alfa-amanitiin, mõnedes Amanita seentes sisalduv mükotoksiin. Mõned seened sisaldavad mükotoksiinide kokteili, mis kindlasti põhjustab vähemalt mõne soolestiku korinat, kui mitte tõsisemaid sümptomeid.
Teadlikkus hallitusseente tekitatavatest mükotoksiinidest on samuti kasvanud alates 1980. aastatest, mil inimesed hakkasid esimest korda mõistma ohtlike hallitusseente ohtu. Teatud hallitusseened, mis nakatavad seinu, vaipu ja nii edasi, toodavad mükotoksiine, mis võivad puudutamisel, sissehingamisel või tarbimisel olla ohtlikud. Inimesed, kes on haigestunud hallitusega kokkupuutest, on mõnel juhul edukalt kaevanud kahju hüvitamiseks, väites, et konstruktsiooni tootja või omanik ei suutnud seda korralikult ehitada ja hooldada, kutsudes esile hallituse sissetungi.
Seente toodetud toksiinid olid tuntud ka antiikmaailmas. Tungaltera, teravilja teradesse nakatunud seen, toodab kuulsalt toksiini, mis põhjustab mitmesuguseid värvilisi sümptomeid. Mõned inimesed on ajalooliselt neelanud tungaltera sihilikult eesmärgiga nautida selle psühhotroopset mõju, ja mõningaid teisi seeni tarbitakse tänapäeval peaaegu samal põhjusel.
Mükotoksiinidega kokkupuute sümptomid on väga erinevad, kuna need on nii mitmekesised. Mükotoksiinide mõju võib samuti varieeruda sõltuvalt kokkupuute kogusest ja kestusest. Paljud mükotoksiinid mõjutavad närvisüsteemi, põhjustades selliseid sümptomeid nagu pearinglus, kohmakus, ähmane nägemine ja segasus, kuid need sümptomid ei ilmne kõigil juhtudel ega kõigi mükotoksiinide puhul.