Luusüsteem on keha tugi. See kaitseb elundeid ja tagab liikumist võimaldavate sidemete, kõõluste ja lihaste ankurduse. Kuigi nii meeste kui ka naiste luusüsteemid sisaldavad sama arvu luid, on nende vahel erinevusi. Meeste ja naiste skeletisüsteemide erinevused on struktuursed ja hõlmavad selliseid piirkondi nagu vaagen, kolju ja jäsemed. Luude mass ja areng on kaks täiendavat erinevust skeletisüsteemides.
Üks meeste ja naiste skeletisüsteemide erinevusi on vaagen. Naise vaagnaluu ja vaagnapiirkond on erineva kujuga kui meestel, kuna naise vaagnapiirkond on valmistatud sünnitusprotsessi võimaldamiseks. Naiste vaagnapiirkonnad on ringikujulisemad ning vaagnaluu on väiksem ja laiem. Seevastu meeste vaagnaõõnsused ei ole nii madalad.
Struktuursed erinevused meeste ja naiste luustiku vahel ilmnevad ka koljus. Kolju tagaküljelt leitud väike väljaulatuv osa, mida nimetatakse väliseks kuklaluu protuberantsiks, on mehe koljul selgemini näha kui naise koljul. Naiste kolju lõualuud on samuti ümaramad, meeste lõualuud aga kandilisemad. Naiste kolju kulmu luud ei ole nii selgelt väljendunud kui meeste kolju luud. Need aspektid loovad eristavaid jooni, mis loovad visuaalseid erinevusi meeste ja naiste näostruktuurides.
Luudel, mis moodustavad luustiku jäsemeid, on ka erinevusi meeste ja naiste luusüsteemide vahel. Küünarluu, raadius ja õlavarreluud on kolm luud, mis moodustavad käed, samas kui pindluu, sääreluu ja reieluu on jala luud. Meestel on need luud üldiselt pikemad ja paksemad kui naistel. Sõrmeluud, mida nimetatakse falangideks, on ka meestel tavaliselt suuremad kui naistel. Mõnedel meestel on aga lühemad luud kui naistel.
Üldmass aitab kaasa meeste ja naiste skeletisüsteemide erinevusele. Meeste luustikud on sageli raskemad ja palju suuremad. Kuigi skeleti mass võib olla üldine võrdluspunkt, ei saa seda kasutada üksi. Mõned mehed on keskmisest väiksemad ja neil on väiksemad luustikud. Lisaks on mõned keskmisest suurema luustikuga naised. Selleks, et teha kindlaks, kas luustik on mees- või naine, tuleb arvesse võtta ka muid olulisi erinevusi koos geneetika ja etnilise päritoluga.
Meeste ja naiste skeletisüsteemide erinevusi mõjutab ka luude areng. Hormoonid mängivad luude kasvus suurt rolli. Meeste jaoks on testosteroon hormoon, mis mõjutab luude kasvu ja kuju, samas kui naissoost hormooni, mis mõjutab luude arengut, nimetatakse östrogeeniks. Puberteedieas on östrogeeni tase naistel palju kõrgem ja meestel testosteroonitase kõrgem, mistõttu naiste luud lakkavad 18. eluaastaks ja meeste kasv peatub 21. eluaastaks.