Kui toit seeditakse, läheb see maost peensoolde, sealt edasi jämesoolde. Teel toimivad erinevad happed ja muud ained toiduga koostoimes, et see lagundada ja võimaldada organismil omastada toitaineid, mida see annab. Nii kõhunääre kui ka maks ühenduvad kaksteistsõrmiksoole peensoolega, lisades soolestikku olulisi aineid nagu sapp, insuliin ja glükagoon. Punkti, kus need ühenduvad soolega, mis asub kaksteistsõrmiksoole peamise papilliga pooleldi piki kaksteistsõrmiksoole teist poolt, nimetatakse Vateri ampulliks.
Tuntud ka kui hepatopankrease ampulla, kannab vateri ampull sapi ühisest sapijuhast ja pankrease sekretsiooni pankrease kanali kaudu peensoolde. Mitmed sulgurlihased tagavad eritiste suunamise õigesse kohta ja takistavad peensoole sisu tagasi voolamist läbi ampulla. Nii sapijuhal kui ka pankrease kanalil on vedeliku voolu reguleerimiseks sulgurlihased. Teine sulgurlihase, hepatopankrease sulgurlihase, kontrollib vedeliku liikumist läbi hepatopankrease ampulla. Seda sulgurlihast tuntakse ka kui Oddi sulgurlihast.
Üks tagajärg, kui sekretsioonid ei voola sujuvalt läbi seedesüsteemi, võib olla pankreatiit. See haigus võib tekkida siis, kui vateri ampull on blokeeritud, näiteks sapikivi tõttu. Kui Vateri ampull on blokeeritud, aktiveeruvad kõhunäärme toodetud seedemahlad, mis sisaldavad insuliini ja glükagooni, mitte kaksteistsõrmiksooles, vaid kõhunäärmes. Pankrease rakud ärrituvad, mis põhjustab põletikku. Pankreatiit viitab kõhunäärme põletikule ja seda võib jälgida ka paljudel muudel põhjustel. Sümptomiteks võivad olla kõhuvalu, iiveldus ja valu kõhus, mis levib alaseljale.
Harva võib hepatopankrease ampullas areneda vähk, mille sümptomiteks on kollatõbi ja valu. Nagu enamik vähivorme, suurendab varajane avastamine taastumise võimalust. Ameerika Ühendriikides diagnoositakse aastas tavaliselt vähem kui 2,000 juhtumit ja see arv moodustab vaid kaks kümnendikku ühest protsendist kõigist diagnoositud seedetrakti pahaloomulistest kasvajatest. Seda tüüpi vähktõbe esineb nii meestel kui naistel võrdse sagedusega ja seda ravitakse nii vähi kui ka osa kahjustatud kaksteistsõrmiksoole eemaldamisega. Vateri ampulli vähk metastaseerub sageli lümfisõlmedesse ja viieaastane elulemus on vaid umbes 40 protsenti.