PET-skaneerimise ettevalmistamise juhised võivad veidi erineda, seega on kõige parem konsulteerida meditsiinitöötajatega individuaalsete reeglite või eeskirjade osas. Üldiselt ei tohiks vähemalt kuus tundi enne protseduuri midagi süüa ega juua. Päev või kaks enne protseduuri võivad kehtida konkreetsed toitumispiirangud või -juhised. Selga tuleks panna mugavad soojad riided, kuigi vältida tuleks kõike, mis sisaldab metalli. Kõik vajalikud paberid tuleb esitada vastavalt meditsiinitöötajate soovitustele ja kõik vajalikud testitulemused, näiteks röntgeniülesvõtted, tuleks vastuvõtule kaasa võtta.
Enamik arste ei soovita vähemalt kuus tundi enne PET-skaneerimise protseduuri midagi süüa ega juua, välja arvatud tavaline vesi. Õige hüdratsiooni ja täpsemate tulemuste tagamiseks tuleks enne protseduuri juua mitu klaasi vett. Kõik kofeiini sisaldavad tooted tuleks dieedist välja jätta vähemalt 24 tundi enne plaanilist PET-uuringut. Diabeedihaigetel võivad PET-uuringu ettevalmistamise ajal olla veidi erinevad toitumisjuhised. Näiteks võib enne protseduuri läbiviimist lubada paar kreekerit koos vajalike ravimitega.
Viimane PET-skannimise ettevalmistamise ajal tarbitav eine peaks tavaliselt olema süsivesikutevaene ja valgurikas. Peekon, munad ja vorst on sobiva hommikusöögi näited. Õhtusöök võib koosneda sellistest toiduainetest nagu praad, kala või kana. Suhteliselt madala süsivesikute sisaldusega köögiviljad on brokoli, seened ja spargel. Toidud, mida tuleks vältida, on riis, leib ja kartul.
Protseduuriruum võib olla üsna jahe, seetõttu tuleks PET-uuringu ettevalmistamise ajal kanda sooja ja mugavat riietust. Vältida tuleks kõiki metalli sisaldavaid riideesemeid, nagu vööpandlad või traadist rinnahoidjad. Enamikul juhtudel tuleks kõik ehted koju jätta, kuigi mõned arstid võivad aeg-ajalt teha erandeid pulmabändidele.
Meditsiinitöötajad juhendavad patsienti kõigis paberitöödes, mida tuleb koguda või täita PET-uuringu ettevalmistamise käigus. Vastuvõtule tuleks kaasa võtta kõik kindlustuskaardid ja praegu võetavate ravimite nimekiri. Vajadusel tuleb enne protseduuri meditsiinipersonalile anda röntgenülesvõte või muud testi tulemused.
Vahetult enne skaneerimist sisestatakse veeni väike kateeter, mida nimetatakse IV-ks ja väike kogus glükoosi süstitakse vereringesse. Seejärel ootab patsient 30 minutit kuni tund enne skaneerimise algust. Skaneerimine ise võtab tavaliselt umbes ühe tunni.