FSH-d ehk folliikuleid stimuleerivat hormooni toodavad gonadotroofidena tuntud rakud, mis asuvad ajupõhjas hüpofüüsis. Hüpofüüs eritab FSH-d vastuseks hormoonile, mida tuntakse GnRH ehk gonadotropiini vabastava hormoonina. GnRH vabaneb teisest ajuosast, mida nimetatakse hüpotalamuks, ja liigub verega hüpofüüsi. Pärast FSH eritumist stimuleerib see munandeid või munasarju suguhormoone tootma. Nn negatiivse tagasiside ahela korral põhjustab suguhormoonide olemasolu veres hüpotalamusest GnRH sekretsiooni vähenemist ja pärsib hüpofüüsi gonadotroofide FSH tootmist, mille tulemusena väheneb FSH tootmine.
Koos teise hüpofüüsi poolt eritatava hormooniga, mida tuntakse luteiniseeriva hormoonina või LH-na, on folliikuleid stimuleeriv hormoon nn gonadotropiin. Gonadotropiinidena mõjutavad nii LH kui ka FSH sugunäärmeid, milleks on munasarjad ja munandid. Naistel mõjutab FSH munasarjade folliikulite küpsemist, milles munarakud arenevad, ja meestel aitab FSH kaasa sperma tootmisele. Nii FSH kui ka LH tekivad hüpofüüsi gonadotroofsetes rakkudes ja kumbki koosneb alfa-subühikust ja beeta-subühikust. Kuigi alfa-subühikud on mõlemas hormoonis samad, on beeta-subühikud, mis seonduvad spetsiifiliste retseptoritega, erinevad.
Ühe menstruaaltsükli lõpu ja järgmise alguse poole degenereerub pärast ovulatsiooni järele jäänud folliikul ehk kollaskeha ning selle suguhormoonide östrogeeni ja progesterooni tootmine väheneb. See suguhormoonide taseme langus stimuleerib hüpotalamust rohkem GnRH-d eritama ja GnRH tõus põhjustab hüpofüüsi FSH produktsiooni suurenemist. Seejärel toimib FSH munasarja folliikulitele, nii et need kasvavad ja küpsevad järgmiseks tsükliks valmis. Meestel aitab see säilitada Sertoli rakke, mis on vajalikud spermatosoidide arenguks.
Naistel jätkub pärast menstruaaltsükli verejooksu tekkimist FSH tootmine ja folliikulite kasv. Alguses toodavad nad vaid väikeses koguses suguhormoone, kuid lõpuks tase tõuseb ja algab negatiivne tagasisideefekt, mille tulemusel hormoonide taseme tõus veres põhjustab GnRH sekretsiooni vähenemist. Hüpofüüsi FSH tootmine väheneb vastavalt, kuid domineeriv folliikul, mis läbib ovulatsiooni, areneb edasi ja eritab östrogeeni. Ilma progesteroonita on östrogeenil positiivne tagasiside GnRH-le ja tase tõuseb ovulatsiooni ajal haripunkti, millele on vastav FSH sekretsiooni tipp. Kui ovulatsioon on toimunud, erituvad nii progesteroon kui ka östrogeen ning nende tase tõuseb, kuni vallandatakse negatiivne tagasiside, GnRH vabanemine väheneb ning LH ja FSH tootmine väheneb veel kord.