Kliid, munad, piim, õunad ja muud tervislikud koostisosad muudavad õunakliimuffinid populaarseks hommikusöögivalikuks, kuid neid saab hõlpsasti ka magustoiduks serveerida. Õunte tüüp ja kogus võivad mängida rolli muffinite tekstuuris, magususes ja hapukuses. Õunakaste on ka tavaline koostisosa. Huvitava maitse ja tekstuuri loomiseks kasutavad paljud pagarid muffinite valmistamisel erinevat tüüpi õunte kombinatsioone. Lisaks võivad inimesed, kes ei ole köögis eriti taibukad, eelistada osta tavalist kliimuffinisegu ja lisada kuubikuteks lõigatud õunu.
Õunakliimuffinite üks ilmsemaid koostisosi on õunad. Õunu on mitut tüüpi ja kasutatav tüüp võib muffinite maitset ja tekstuuri oluliselt mõjutada. Sageli kasutavad inimesed õunte kombinatsiooni, nii et muffinites on meeldiv hapukuse ja magususe segu. Üks levinud kombinatsioon on kuldsed maitsvad õunad magusaks ja granny smith õunad hapuks. Kuigi enamikku õunu saab hõlpsasti küpsetada, ei küpse teatud tüüpi õunad hästi ja neid kasutatakse muffinites harva, näiteks punased maitsvad õunad.
Õunakliimuffinites on tavaliselt väikesed õunatükid, kuid mõned inimesed eelistavad muffinite tekstuuri, kui kasutatakse peeneks hakitud õunu. Kasutatava õuna kogus sõltub retseptist. Lisaks naudivad paljud inimesed muffinites õunakastme kasutamist niiskuse lisamiseks. Õunamaitse suurendamiseks ja tekstuuri loomiseks kasutavad inimesed aeg-ajalt nii väikeseid ja suuri õunatükke kui ka õunakastet.
Muffinites kasutatud kliide kogus võib muuta ka maitset ja tekstuuri. Enamik retsepte nõuab nisujahu ja kliide segu. Nisukliijahu annab muffinitele loomuliku tervisliku maitse. Isegi kodus õunakliimuffineid valmistades ostavad mõned inimesed kliimuffinisegu ja lisavad lihtsalt soovitud koguse õunu. Maitse, tekstuuri ja tervisega seotud eeliste lisamiseks lisatakse muffinitaignale tavaliselt ka pähkleid.
Inimestele meeldib süüa õunakliimuffineid erinevatel kellaaegadel. Kõige tavalisem aeg igasuguste muffinite söömiseks on hommikusöök ning õunakliimuffinid pakuvad süsivesikute ja puuviljade kombinatsiooni, mida paljud inimesed eelistavad hommikul süüa. Paljud inimesed usuvad ka, et õunakliimuffinid on suurepärane valik magustoidu muffiniteks. Mõned inimesed panevad muffinile peale suhkrut, mett või vahukoort. Ka muffinite serveerimine karamelliseeritud õuntega on tavaline õhtusöögijärgne maiuspala.