Küüslaugu ensüümid on teaduslikult tuntud kui alliinaasi ensüümid. Need ensüümid muudavad alliini, küüslaugu aminohappe allitsiiniks, fütokemikaaliks, mida nimetatakse vererõhu alandamiseks, kolesterooli vähendamiseks ja immuunsüsteemi tugevdamiseks. Alliinaasi ensüümid muutuvad aktiivseks ainult küüslaugu viilutamise, närimise, tükeldamise või purustamise käigus vabanemisel. Küüslaugu ensüümid, mida peetakse küüslaugu kõige võimsamateks komponentideks, annavad köögiviljale iseloomuliku maitse ja lõhna.
Küüslaugu ensüümid, mis esinevad valdavalt küüslaugust vabanevas õlis, seisavad küüslaugurakkude membraanides kuni küüslauguga manipuleerimiseni. Viilutamine ja purustamine hävitavad membraanid, vabastades ensüümid. Kuumutamisel ja keetmisel on vastupidine mõju ja see võib tappa enamiku küüslaugu ensüümidest.
Lisaks tervele värskele küüslaugule on küüslauguensüüme saadaval neljas toidulisandivalikus: küüslauguõli leotis, küüslaugu ekstrakt, jahvatatud küüslaugust võetud küüslaugu eeterlik õli ning jahvatatud, kuivatatud küüslaugust valmistatud küüslaugupulber. Viimane on tavaline maitseaine. Mõned uuringud vaidlustavad aga selle, et küüslaugu ensüümid toidulisandites on ebaefektiivsed. Laboratoorsetes uuringutes on näidatud, et ainult ekstraktilisandi vorm on paikselt manustatud.
Tervise valdkonnas peetakse küüslaugu ensüüme bakteritsiidseteks aineteks, mis on võimelised hävitama kahjulikke bakteritüvesid. Sel põhjusel on küüslauku kasutatud kurgupõletiku ja muude infektsioonide raviks. Mõned uuringud näitavad, et need ensüümid võivad tappa ka viiruseid; need teadmised on julgustanud küüslauku kasutama inimese immuunpuudulikkuse viiruse (HIV), herpese ja teiste sugulisel teel levivate haigustega patsiente.
Küüslaugu ensüümide kasutamine vähemalt viie vähiliigi raviks on endiselt küüslaugu kõige levinum tervisekasutus. Meditsiiniliste andmete kohaselt võib küüslaugu suur tarbimine väidetavalt ära hoida või tagasi pöörata käärsoole- ja maovähki. Küüslaugule reageerivad ka pahaloomulised kasvajad söögitorus, rinnas ja kõhunäärmes. Uuringud näitavad, et ensüümide kasulikkus ei ilmne isoleeritud ensüümide puhul, vaid ainult siis, kui alliinaas on küüslaugus koos teiste fütokemikaalidega, nagu alliin ja allitsiin. Seetõttu arvavad paljud, et parim viis ensüümide tarbimiseks on kogu küüslauguküüne regulaarne tarbimine; Tervisekaitsjad soovitavad võtta üks nelk päevas.
Meditsiiniringkondades on tekkinud mitmeid teooriaid, mis selgitavad küüslauguensüümide mõju vähile. Üks teooria on see, et küüslaugus sisalduvad ensüümid ja muud kemikaalid pärsivad kantserogeenide aktiivsust. Teine teooria on see, et küüslauk võib peatada vähirakkude paljunemise ja parandada kahjustatud rakke, nii et need on taas terved. Täiendav teooria on see, et küüslaugu tarbimine põhjustab vähikoe surma.