Kahetaktiline mootor on sisepõlemismootori tüüp, mis ühendab tüüpilise gaasi- või diiselmootori neli toimingut kahetaktiliseks. Bensiinimootoriga kahetaktilisi mootoreid võib leida sellistest esemetest nagu mootorsaed ja päramootorid, samas kui kahetaktilisi diiselmootoreid kasutatakse tavaliselt vedurite ja laevade toiteks. Tüüpilised neljataktilised mootorid läbivad sisselaske-, kompressiooni-, põlemis- ja väljalasketsükli. Kahetaktiline mootor teeb samu toiminguid, kuid sellel on ainult survetakt ja põlemistakt – sisse- ja väljalaskeavad on ühendatud kompressiooni- ja põlemistaktidesse.
Põhimõtteliselt koosneb kahetaktiline mootor silindrilises kambris olevast kolvist. Kolvi ühel küljel on survekamber ja teisel pool karter. Süüteküünal asub survekambri otsas. Sisselaske- ja väljalaskeavad asuvad silindri seintes.
Survetakti ajal surub kolb õhu ja kütuse segu kokku, liikudes samal ajal süüteküünla poole. Samal ajal tõmmatakse karburaatorist läbi sisselaskeava karterisse veel üks segu õhust, kütusest ja õlist. Kui kolb jõuab survetakti lõpuni, süttib süüteküünal ja algab põlemistakt.
Kui süüteküünal süttib, süttivad suruõhk ja kütus survekambris, mis sunnib kolvi põlemistakti ajaks allapoole. Kui kolb liigub allapoole, jääb väljalaskeava katmata ja rõhk silindris surub heitgaasid välja; samal ajal surub kolvi liikumine õhku ja kütust karteris kokku. Kui kolb jõuab oma käigu põhja, avatakse sisselaskeklapp ja karteris olev rõhu all olev kütusesegu väljub silindrisse. Seejärel algab kompressioonikäik uuesti.
Kahetaktiline diiselmootor töötab samamoodi, ühe olulise erinevusega: ainult õhk tõmmatakse kambritesse ja surutakse kokku. Kütus pihustatakse otse survekambrisse ja see süttib rõhu ja temperatuuri mõjul koheselt. Kahetaktilistel diiselmootoritel peavad olema ka turbolaadur ja ülelaadur, mis suruvad kokku mootorisse tuleva õhu, muutes need suuremaks ja kallimaks kui kahetaktilised bensiinimootorid.
Kütuse kasutusviiside erinevuse tõttu kasutatakse kahetaktilisi bensiinimootoreid väikeste tööriistade ja sõidukite jaoks, nagu muruseadmed ja meelelahutuslikud veesõidukid, samas kui kahetaktilisi diiselmootoreid kasutatakse palju suuremates rakendustes, nagu laevad ja rongid. Kumbagi ei kasutata tavaliselt autodes, kuna kahetaktilised bensiinimootorid kuluvad kiiremini, on vähem kütusesäästlikud ja põhjustavad rohkem saastet kui neljataktilised mootorid. Üldiselt on kahetaktilised diiselmootorid ka tavalise auto jaoks liiga suured.