On palju erinevaid aminohappeid, mis toimivad valkude põhiliste struktuuriüksustena ja täidavad paljusid muid olulisi bioloogilisi funktsioone. Need on rühmitatud mitmesse kategooriasse, mis põhinevad mitmel erineval teguril, nagu mehhanismid, mille kaudu neid sünteesitakse, ja see, kas neid saab toiduga omandada või mitte. Kõik aminohapped sisaldavad amiinirühma või ühendit, millel on lämmastik koos üksiku elektronpaariga. Neil on ka karboksüülhapperühm, mis on happed, mis hõlmavad süsinikuaatomi, hapnikuaatomi ja hüdroksiidi molekuliga seotud ühendit. Erinevaid tüüpe eristab kõrvalahel, mis on igale aminohappele ainulaadne.
Erinevat tüüpi aminohappeid rühmitatakse tavaliselt standardseteks ja mittestandardseteks aminohapeteks. Standardseid aminohappeid toodetakse normaalsete bioloogiliste protsesside kaudu, mille käigus DNA-s sisalduv geneetiline informatsioon transkribeeritakse RNA-ks ja tõlgitakse aminohapeteks. Seal on 20 aminohapet, mida toodetakse selliste standardsete bioloogiliste protsesside kaudu, samas kui veel kaks standardset aminohapet toodetakse spetsiaalsemate sünteesiprotsesside kaudu, mis suurendab standardsete aminohapete koguarvu 22-ni.
Teisest küljest ei toodeta mittestandardseid aminohappeid tavapäraste transkriptsiooni ja translatsiooni vahenditega. Tavaliselt on need standardsete aminohapete modifitseeritud versioonid; nad läbivad mingisuguse translatsioonijärgse modifikatsiooni, mis toimub pärast valgu tootmise tavalisi faase. Valgud, millel on väga spetsiifilised funktsioonid või mis peavad seonduma spetsiifiliste molekulidega, sisaldavad sageli mittestandardseid aminohappeid, kuna 22 standardset aminohapet ei ole piisavalt spetsialiseerunud.
Erinevat tüüpi aminohappeid rühmitatakse ka erinevate loomade, tavaliselt inimeste, toitumisvajaduste alusel. Asendamatuid aminohappeid, nagu fenüülalaniin, ei saa keha sünteesida, mistõttu tuleb neid tervise säilitamiseks tarbida oma dieedi osana. Keha saab sünteesida asendamatuid aminohappeid, nagu alaniin, nii et neid ei pea tingimata oma dieeti sisaldama. Mõisted “oluline” ja “mitteoluline” ei viita nende tähtsusele; mõlemad tüübid on vajalikud. See viitab lihtsalt asjaolule, et üks on inimese dieedi oluline osa, teine aga mitte.
Aminohappeid saab jagada kategooriatesse paljude erinevate tunnuste alusel. Üks biokeemias tavaliselt kasutatav tunnus on aminohapete struktuur. Erinevad aminohapped on rühmitatud teatud aatomite või molekulide või nendes sisalduvate struktuuriliste paigutuste alusel. Kaks erinevat struktuurikategooriat on aromaatsed aminohapped ja väävlit sisaldavad aminohapped.