Vagusnärv, mis kulgeb maost ajju, võib saada mitmel erineval viisil kahjustatud. Üks levinumaid kahjustusi on põhjustatud hormonaalsest tasakaalustamatusest. Vigastusest või operatsioonist tulenev füüsiline kahjustus võib samuti põhjustada kahjustusi. Mõnel patsiendil võib olla kahjustusi ka viirus- või bakteriaalne infektsioon või vähkkasvaja mis tahes punktis närvi pikkuses. Seda tüüpi vaguse närvikahjustuste tagajärjeks on sageli seedesüsteemi funktsioonide vähenemine.
Suhkurtõbi on üks levinumaid vagusnärvi kahjustuste põhjuseid. Patsiendid, kellel on see haigus pikka aega põdenud, võivad kahjustada kogu keha närve, sageli ebaõige verevoolu tõttu. Ilma piisava vereta võib vaguse närv jäädavalt kahjustada. Vähk võib kahjustada ka närvi ja aju kasvajad või närvisüsteemi verevoolu häirivad kasvajad võivad seda samuti kahjustada.
Samuti on võimalik, et vaguse närv võib saada vigastuse patsiendi keha traumast. Närv on maetud sügavale kehasse ja ajju, nii et närvi vigastamiseks tuleb patsienti oluliselt kahjustada. Patsientidel, kellele tehakse aju või seedesüsteemi operatsioon, võib see sagedamini kahjustuda.
Alkoholism võib põhjustada teist tüüpi vaguse närvi kahjustusi. Selle haigusega patsientidel võib kogu kehas esineda närvifunktsiooni halvenemist. Paljudel juhtudel on kahju aga pöörduv, kui patsient joomise lõpetab.
Teatud tüüpi närvikahjustused on põhjustatud infektsioonist. On teada, et viirused levivad kõrvadest, ninast ja kurgust vagusnärvi, mis kulgeb nende elundite taga. Viirusnakkust võib olla raske ravida ja see võib põhjustada pöördumatut närvikahjustust. Bakteriaalsed infektsioonid võivad levida ka vagusnärvi, kuigi neid infektsioone saab sageli ravida antibiootikumide kasutamisega.
Igasugune vaguse närvi kahjustus võib põhjustada gastropareesi. Selle haigusseisundiga patsientidel on seedetrakti liikuvus vähenenud, kuna vaguse närv vastutab piisava koguse vere suunamise eest seedesüsteemi, et see saaks toitu kiiresti ja tõhusalt töödelda. Pöördumatu närvikahjustusega patsientidel saab seda seisundit meditsiiniliselt kontrollida, kuigi seda ei saa ravida.