Pannikoogi valmistamisel on kõige parem kasutada rasket panni, mida on ohutu ahju panna. Kooki ei tohi pärast küpsetamise lõppu liiga kaua küpsetada ega jätta liiga kauaks pannile seisma. Pagar saab pannil valmistada väga erinevaid kooke, alates puuviljadega kaetud kookidest kuni tagurpidi ja šokolaadikookideni.
Malmpann on üldiselt parim pannitüüp pannikoogi valmistamiseks. Malm kuumeneb ühtlaselt ja on ka ahjukindel kuni väga kõrge temperatuurini. Kuna enamus malmpannid on maitsestatud, ei jää kook vormi külge kinni.
Teine võimalus on kasutada roostevabast terasest panni või muud ahjukindlat panni. Paljud mittenakkuvad pannid või plastikust käepidemega pannid ei sobi ahjus kasutamiseks. Kui pagaril on elektripann, võib ta proovida pannil kooki küpsetada ja ahju üldse mitte kasutada. Elektrilise panni kasutamine võib olla suurepärane idee suvel, kui ahju kasutamiseks on liiga kuum.
Kuna malm säilitab kuumust kaua, tuleks pannikook 15 minuti jooksul pärast küpsetamist pannilt eemaldada, et koogi põhi ja küljed üle ei küpseks. Pagar peaks laskma pannil ja koogil restil 10–15 minutit jahtuda ning seejärel pannil ümber pöörata ja kook ettevaatlikult eemaldada. Noaga ümber panni külgede jooksmine muudab koogi eemaldamise lihtsamaks.
Pärast pannilt eemaldamist eelistavad mõned kokad kooki enne serveerimist toatemperatuurile jahutada. Teised serveerivad pannikooki soojalt. Suvel võib eelistada jaheda ja talvel sooja kooki.
Pannikoogi koostisained võivad olla väga erinevad. Mõned retseptid nõuavad kohvikoogipõhja valmistamiseks segude või isegi valmistatud taina kasutamist. Mõned koogid on loodud sünnipäevatorte jäljendama ja on väga magusad, nagu šokolaadiglasuuriga serveeritud šokolaadikoogid.
Puuviljadega kaetud kohvikooki valmistatakse tavaliselt pannil. Mõned koogid nõuavad puuvilju puistamist taigna peale. Puuvilju võib asetada ka pannipõhjale, et need koogi küpsedes karamellistuks. Serveerimiseks keeratakse kook tagurpidi, et vili oleks koogi peal.