Madala kalorsusega muffineid saab osta kaubanduslikult või valmistada kodus. Erinevate maitsetüüpide hulka kuuluvad kliid, puuviljad, köögiviljad ja šokolaad. Pigem soolaste kui magusate madala kalorsusega tüüpide hulka kuuluvad maisijahu ja inglise muffinid. Nii rasva kui ka suhkru lõikamine muffiniretseptides võib luua madala kalorsusega valikuid. Rasvavaba piim, õli või asemel ja munavalged, pigem terved munad, on viise rasvade vähendamiseks, samas kui õunakastme asendamine osa suhkrust võib ka kalorite arvu vähendada.
Puuviljad, nagu banaanid ja marjad, on populaarsed lisandid madala kalorsusega muffiniretseptidele. Madala kalorsusega küpsetamisel võib kasutada ka köögivilju, nagu suvikõrvits või bataat. Kui kalorite hulk on kontrolli all, võivad sobida ka magusamad sordid, näiteks need, mis sisaldavad šokolaadi. Šokolaaditükkide või magustatud küpsetusšokolaadi asemel kasutatakse madala kalorsusega muffinites sageli madala suhkrusisaldusega või isegi suhkruvabu sorte. Samuti ei saa õunakastme kasutamine kalorite vähendamiseks asendada ainult osa suhkrut, vaid arvatakse, et see toob esile ka šokolaadi maitse.
Muffinites kasutatav bataat ja suvikõrvits võivad lisada maitset ja vitamiine ilma palju kaloreid. Nendes köögiviljade madala kalorsusega muffinites võib kaneel palju magustada, mis võib vähendada vajaliku suhkru kogust. Mõnele pagarile meeldib suvikõrvitsa- või maguskartulimuffinitele lisada muid maitsvaid vürtse, näiteks ingverit ja muskaatpähklit. Kuna pruun suhkur on rikkalikuma maitsega kui valge, võib magusainet vaja minna vähem.
Mustika madala rasvasisaldusega muffinid on üks levinumaid saadaolevaid tüüpe. Need võivad olla valmistatud valgest jahust, mis võib olla madala kalorsusega, kuid ei paku täisteratooteid, nagu nisu- või kliimuffinid. Maasikas ja vaarikas on ka puuviljapõhised madala kalorsusega muffinivalikud. Mõnele kokale meeldib nendest puuviljadest täidist valmistada, kühveldades osaliselt maisijahust taigna muffinivormidesse, seejärel lisades puuvilju ja lisades sellele veel taigna.
Maisijahust valmistatud madala kalorsusega muffinid võivad olla ka soolased, kui täidate need pigem salsaga kui puuviljadega. Seda tüüpi vähendatud kalorsusega muffineid võib serveerida koos roaga, nagu hautis või supp. Tavaliselt ei vaja soolased maisijahu muffinid väga palju suhkrut ja või asemel võib kasutada õli. Ka inglise muffinid ei ole tavaliselt liiga magusad, kuid erinevad teistest madala kalorsusega muffinitest selle poolest, et neid ei küpsetata ahjus, vaid tehakse küpsetusplaadil. Enne inglise muffinitaigna lisamist asetatakse kuumutatud plaadile metallrõngad.