Immuunsüsteemiga raseduse ajal toimuv mõjutab mitmesuguseid tegureid. Mõned uuringud näitavad, et naise immuunvastus on sel ajal tõenäolisemalt langenud ja see võib juhtuda erinevatel põhjustel. Kui palju või isegi see, kas naine seda mõjutab, sõltub peamiselt tema elustiilist, tervisest ja sellest, kui tugev oli tema immuunsüsteem alguses. Kuna iga inimene reageerib rasedusele veidi erinevalt, ei ole võimalik täpselt teada, kuidas tema keha reageerib.
Üheks võtmeteguriks, mis raseduse ajal immuunsüsteemis muutub, on hormoonid. Hormonaalse tasakaaluhäire ja nõrgenenud immuunsüsteemi vahel on seos. Samuti on tõsi, et naise keha teeb kõvasti tööd, et anda oma arenevale lapsele toitu, nii et teised kehasüsteemid saavad sageli löögi. See hõlmab immuunsüsteemi, eriti naistel, kes ei juhi tervislikku eluviisi. Immuunsust tugevdava toidu söömine ja rohke liikumine võivad selle vastu võidelda.
Teine tegur, mis raseduse ajal immuunsüsteemiga seoses mängib, on väsimus, mida paljud naised kogevad esimesel ja kolmandal trimestril. Unepuudus võib pikaajalisel ajal nõrgendada immuunsüsteemi ja rasedatel naistel esineb sageli raseduse ajal mingil hetkel unetus. Põhjuseks võivad olla nii hormonaalsed kõikumised kui ka hommikusest iiveldusest tingitud ebamugavustunne, lihaste ja naha venitamine ning muud rasedushädad. Öösel urineerimiseks püsti tõusmine, kuna emakas surub põit allapoole, võib samuti kaasa tuua vähem kosutava une. Selle vastu võitlemiseks peaksid rasedad naised minema veidi varem magama ja võimalusel tegema igapäevaseid uinakuid.
Mõnel naisel võib olla ka raseduse ajal nõrgenenud immuunsüsteem, sest kasvav laps tühjendab oma toitainete varusid kiiremini, kui ta neid täiendab. Kasvav loode vajab oma üheksa arengukuu jooksul palju toitu ja kui ema ei söö piisavalt õiget toitu, saab laps vajalikku toitu ema toitainevarudest. See jätab ema keha normaalseks toimimiseks vähem toitaineid ja see võib põhjustada immuunsüsteemi nõrgenemist. Selle probleemi lahendamiseks peaksid kõik rasedad naised sööma tasakaalustatult täisteratooteid, puuvilju, köögivilju, lahja valke ja madala rasvasisaldusega piimatooteid. Rasedatel naistel soovitatakse rääkida oma arstiga õigest raseduse toitumisest, kuna mõned toidud võivad olla keelatud.
Teine probleem, mida on raseduse ajal immuunsüsteemiga seoses täheldatud, on tõsiasi, et mõnikord võib ema immuunsüsteem reageerida kasvavale lapsele negatiivselt. Enamikul naiste kehadel on selle vastu kaitsvad rakud, kuid mõnel juhul võib tekkida raseduse katkemine. Samuti arvatakse, et preeklampsiat võib põhjustada immuunvastus.