Basaalganglionid on aju tuumade kogum, mis vastutab vabatahtliku liikumise ja õpitud ülesannete täitmise eest. Selle ajupiirkonna kahjustus põhjustab motoorsete ülesannete ja kontrollimatute kehaliigutuste probleeme. See kahjustus võib olla põhjustatud traumast, kuid tõenäolisemalt tekib ajuhaiguse või häire tagajärjel. Peamised basaalganglionide haigused on Parkinsoni tõbi, tardiivdüskineesia, hemiballismus ja Huntingtoni tõbi.
Parkinsoni tõbi on teatud tüüpi hüpokineetiline häire, mis tähendab, et see põhjustab motoorse kontrolli ja liikumiskiiruse vähenemist. See häire on tingitud madalast dopamiini tasemest basaalganglionides. Parkinsoni tõbe iseloomustavad värinad, jäikus, aeglane liikumine, kõnnimustrid ja depressioon.
Peale Parkinsoni tõve on basaalganglionide haigused hüperkineetilised häired. Basaalganglionide aktiivsuse vähenemise tõttu on liikumiskontroll mõjutatud ja tulemuseks on kontrollimatud liigutused. Need liigutused võivad olla värinad, jäsemete tõmblused või kiired vahelduvad lihasliigutused.
Tardiivne düskineesia on põhjustatud basaalganglionide dopamiiniretseptorite probleemidest. Retseptorid muutuvad dopamiini suhtes liiga tundlikuks, mis põhjustab kontrollimatuid lihaste liigutusi. Selliseid liigutusi on kõige sagedamini näha näo lihastes. Hemiballismust iseloomustavad tahtmatud liigutused ainult ühel kehapoolel.
Üks kõige kurnavamaid basaalganglionide haigusi on Huntingtoni tõbi. See häire on pärilik ja põhjustab olulisi probleeme kõne, liikumise, tunnetuse ja käitumisega. Jäsemete tegevus on tõmblev ja kõne tootmine väheneb järk-järgult. Haigus on progresseeruv ja lõppeb surmaga.
Mõned tõendid viitavad sellele, et Tourette’i sündroomi võivad vähemalt osaliselt põhjustada probleemid basaalganglionides. Katkestused basaaltuumade närviahelates võivad põhjustada selle häirega seotud kontrollimatuid tikke ja puhanguid. Samamoodi võivad teatud tüüpi obsessiiv-kompulsiivsed häired olla selle ajupiirkonna düsfunktsiooni tagajärg. Nende häirete ja nende seoste uurimine basaalganglionidega algas 20. sajandi lõpus, kuid on viinud uute haiguste ravivormide väljatöötamiseni.
Basaalganglionide haiguste uurimine on suurepärane vahend selle keerulise ajupiirkonna kohta rohkem teada saamiseks. Basaaltuumade liigne aktiivsus võib põhjustada hüpokineetilisi liigutusi, mida on raske algatada, samas kui alaaktiivsus võib põhjustada kiireid ja kontrollimatuid liigutusi. Parema arusaamise saamine aktiivsuse muutuste põhjustest võib olla võti erinevate basaalganglionide haiguste ravimisel.