Otsus selle kohta, millal küpsised kustutada, peaks põhinema võrgutegevusega seotud turvaprobleemidel, Interneti-ühenduse kiirusel ja sageli külastatavatel veebisaitidel. Kuna brauseri küpsised on mõeldud sageli külastatavate veebisaitide laadimise kiirendamiseks ja ka üksikute külastajate saidi kasutamise jälgimiseks, on neil nii positiivseid kui ka negatiivseid väärtusi. Paljud viirusetuvastusprogrammid leiavad oma funktsioonide peamise allikana üles arvukalt jälgimisküpsiseid, mis on kasutajate arvutitesse kopeeritud, ning seda tüüpi küpsiste automaatse kustutamise seadistus on asjakohane. Kuigi küpsised on viirustarkvara poolt tuvastatud kõige kahjutumad failitüübid, installitakse need ka ilma kasutaja loata või teadmata ning need võivad põhjustada lünki turvatulemüürides. Arvuti turvalisuse suurendamiseks on küpsiste sagedane kustutamine parim valik.
Tavaliselt lahendab enamiku probleemide eest perioodiline küpsiste kustutamise protsess arvutist. Kuigi küpsised on loodud veebisaidile juurdepääsu kiirendamiseks, on need eelkõige kasulikud veebisaidi enda turundusaspektidele, mitte külastajale. Küpsised võtavad ka arvuti kõvakettal väga vähe ruumi, kuna need on väikesed tekstiandmefailid, mistõttu saab neid tuhandeid kaasaegses personaalarvutis salvestada, ilma ruumi märgatavalt monopoliseerimata.
Küpsistel on mitu erinevat nimetust, sealhulgas hüperteksti edastusprotokolli küpsis (HTTP küpsis), veebiküpsis või brauseri küpsis, kuid need kõik salvestatakse tekstifailidena ja täidavad sarnaseid funktsioone. Nende esmane ja algne kasutusala, kui Interneti-kiirus oli varasematel aastakümnetel palju aeglasem, oli külastaja tegevuse jälgimine veebisaidil turunduse ja optimeerimise eesmärgil, kui külastaja hiljem naasis. See võimaldaks veebilehtede kiiremat laadimist, külastaja konkreetsetele huvidele suunatud reklaamimist ning säilitaks eelnevalt täitmata ostukorvi andmete üle arvestust.
Veebisaidi liikluse jälgimine võimaldab ka mõningast isikupärastamist, kui kasutaja on saidil täitnud vormi, kus saab seejärel nimeliselt adresseerida, graafikat laadida individuaalsete huvide alusel ja palju muud. Selliste turundustavade peamine negatiivne külg on see, et küpsised ei ole mingil juhul turvalised failid. Kui need sisaldavad veebisaidile salvestatud või külastaja esitatud tundlikku teavet, saavad neid hõlpsasti lugeda kõik, kes teavad nende asukohta või kes suudavad neid Interneti kaudu edastamise ajal jäädvustada.
Küpsised on tegelikult reaalajas logifailid kellaaja, kuupäeva ja kasutaja konkreetse tegevuse kohta arvutis, kui kasutaja veebisaitidega suhtleb. Kui Interneti-juurdepääs luuakse avalikus või töökeskkonnas, on privaatsuse säilitamiseks kõige parem kustutada küpsised pärast Interneti-seansi lõppu. Kui kasutaja pole kunagi varem veebisaiti külastanud, luuakse esimesel külastusel vaikimisi küpsis.
Kuigi brausereid saab seadistada küpsiste allalaadimist blokeerima, väidavad paljud saidid, et need ei tööta ega laadi korralikult, kui see funktsioon on keelatud. Iseenesest on küpsised üsna kahjutud, kuid võivad häkkeritele kontoteabe hankimiseks avada turvalünga ja olla Interneti-tegevuse keerukas salvestussalvestus. Turvalisuse ja privaatsuse säilitamise parim tava on küpsiste kustutamine igal võimalusel.