Kahjustatud immuunsüsteem ei tööta nii hästi kui peaks, kuna komponendid on nõrgenenud või puuduvad. Patsientidel võib meditsiinilise ravi, põhihaiguse või kaasasündinud seisundite tõttu tekkida immuunpuudulikkus, nagu on teada. Kuni immuunsüsteem ei ole täielikult funktsionaalne, on patsiendil suurem risk infektsioonide tekkeks ja ta on vähem võimeline nendega võitlema. Nende probleemide lahendamiseks on saadaval ravimeetodid, olenemata sellest, kas immuunpuudulikkus on ajutine või püsiv.
Mõnel patsiendil on kaasasündinud immuunpuudulikkus, mis tähendab, et nende immuunsüsteem ei tööta korralikult, kuna nende keha ei suuda toota teatud rakke ega reguleerida immuunfunktsiooni. Muudel juhtudel on kahjustatud immuunsüsteem omandatud seisund, mis on põhjustatud kokkupuutest toksiinidega, infektsioonidega nagu inimese immuunpuudulikkuse viirus (HIV) või teatud ravimitega. Mõned ravimid võivad kõrvaltoimena pärssida immuunfunktsiooni, mida täheldatakse vähiravimite ja mõnede steroidide puhul. Ravist saadav kasu kaalub üles riskid, kuid patsienti tuleb kogu ravi vältel jälgida.
Teatud meditsiinilised ravimeetodid võivad nõuda kahjustatud immuunsüsteemi tahtlikku esilekutsumist. Näiteks siirdamiseks valmistuvad patsiendid peavad oma immuunsüsteemi alla suruma, et nad siirdamist tagasi ei lükkaks. Samuti peavad nad kogu elu võtma immuunsupressiivseid ravimeid, et ära hoida äratõukereaktsiooni. Vahetult enne luuüdi siirdamist võib esile kutsuda ajutise tõsise immuunpuudulikkuse seisundi, kus doonori luuüdi asendab lõpuks immuunfunktsiooni.
Nakkusorganismid jäävad tõenäolisemalt kinni kahjustatud immuunsüsteemiga patsientidele, sealhulgas haruldased organismid, mis tavaliselt tervetel inimestel haigusi ei põhjusta. Kehal puuduvad kaitsemehhanismid bakterite, viiruste ja muude haiguste põhjuste tuvastamiseks ja hävitamiseks. Peale selle, kui infektsioon areneb, ei suuda keha seda alla suruda. See tähendab, et “tavaline” külmetus või gripp võib muutuda raskeks, sest patsiendi kehal ei ole samasuguseid kohanemisi kui tervetel inimestel.
Patsiendid tuleb isoleerida, kui nende immuunsüsteem on eriti nõrk. See võib toimuda haiglas või turvalises kodukeskkonnas. Teistele võidakse soovitada olla ettevaatlik potentsiaalsete kokkupuuteallikate suhtes, nagu väikelapsed, kes võivad klassiruumist kaasas kanda viiruste segu, või toiduained, mis teadaolevalt kannavad nakkusohtlikke organisme. Ravimid võivad teatud juhtudel parandada kahjustatud immuunsüsteemi, kuid neid võib olla vaja tasakaalustada muude terviseprobleemidega, mis võivad tekitada vastunäidustusi, kui ravimi kasutamine ei oleks ohutu.