Mõnikord ei piisa kõhuõõne või vaagnapiirkonna ultraheliuuringust suguelundite visualiseerimiseks või raseduse kohta üksikasjade kogumiseks. Kui see nii on, eriti raseduse väga varases staadiumis, võivad arstid selle asemel määrata transvaginaalse ultraheliuuringu. Lihtsamalt öeldes on see ultraheli, kus Doppler või andur asetatakse tuppe põhjalikumaks uurimiseks ja suguelundite või raseduse lähemaks vaatamiseks.
Kui see pole eriti tundlik, ei pea enamik naisi transvaginaalset ultraheli ebamugavaks protseduuriks. See sarnaneb vaagnaeksamiga, tavaliselt kestab see mõnevõrra kauem. Enamik naisi võib eeldada, et nad lamavad selili ning nad või tehnik võivad hästi määritud ja ümbrisega anduri tuppe panna. Ultraheli tehnik või tehnoloog, et uurida vaagnat, munasarju, emakat ja emakakaela, manipuleerib õrnalt anduri osaga, mis ulatub välja tupest. Neid vaateid loetakse seejärel ekraanilt ja tehnoloogia suudab suurendada nii konkreetseid piirkondi kui ka heli, et kuulda näiteks lapse südamelööke või vaadata selliseid asju nagu mitmikrasedused, tsüstid või muud murettekitavad kõrvalekalded.
Üks asi, mis transvaginaalse ultraheli ja kõhuõõne tüübi vahel erineb, on see, et uuringut ei tehta, kui naistel on põis täis. See on tavaliselt nõue, kui ultraheli Doppler peab liikuma üle mao, kuna see aitab paremini visualiseerida all olevaid struktuure. Tupe ultraheli ei oleks soovitatav teha täis põie korral, arvestades nende asukohta ja pealegi pole see vajalik vaagnapiirkonna suurema läheduse tõttu. Transvaginaalse ultraheli soovitamine võib oluliselt leevendada naisi, kellel on raskusi uriini pikaajalisel hoidmisel, nagu see on tavaline raseduse ajal.
Raseduse ajal kogevad mõned naised transvaginaalset ultraheli väga varajases staadiumis, kui loode on väike, sageli alla 12 nädala vanused. Protseduuri saab tellida ka muudel põhjustel. Seda võiks soovitada mitmesuguste suguelunditega seotud kaebuste skriinimise vahendina. Selliseid asju nagu fibroidid, kasvajad, tsüstid, infektsioon või endometrioos võib leida transvaginaalselt, kuigi mõnda neist võib leida ka tavaliste kõhuõõne ultraheliuuringute käigus. Arvatavad probleemid rasedusega või vajadus otsida võimalikke defekte võivad samuti viidata transvaginaalsele lähenemisele, kuigi tuleb märkida, et see lähenemisviis ei viita alati kahtlustatavatele terviseprobleemidele.
Paljudel juhtudel tehakse naistele raseduse ajal mitu ultraheli. Osa neist testidest võib läbi viia vaginaalselt, isegi raseduse edenedes. Mõnikord on loote südamelöökide põhjalikum vaatamine või kuulamine soovitavam, kuid see ei pruugi tähendada, et testi tegija arvab, et probleem on olemas.
Kui naise arst ei tee mis tahes tüüpi ultraheli, võivad naised oodata tulemusi paar päeva. Tehnikatöötajatel ja isegi personali radioloogidel ei ole tavaliselt lubatud patsientidega tulemusi otse arutada. Probleemide korral teavitatakse patsiendi arsti tavaliselt üsna kohe ja tõenäoliselt võtab ta peagi patsiendiga ühendust, et tulemusi arutada.