Käbinääre asub väikeaju kohal ja inimese aju keskpunkti lähedal. Nääre on väga väike, alla 1/2 tolli (1.27 cm) suurune. Melatoniini süntees toimub käbinäärmes vastusena valguse muutustele. Inimestel reguleerib see hormooni sekretsioon und ja see on seotud vanusega seotud haiguste ja hooajaliste afektiivsete häiretega (SAD).
Silma võrkkest edastab teavet valguse kokkupuute kohta käbinäärmele. Käbinääre kasutab seda teavet inimese bioloogilise kella koordineerimiseks. Melatoniini sekreteerib käbinääre öösel, et aidata uinuda, samal ajal kui valgus pärsib melatoniini tootmist. Päevasel ajal on melatoniini sekretsioon peaaegu null.
Käbinääre ja melatoniin on seotud hooajaliste afektiivsete häiretega. Talvekuudel põhjapoolsetel laiuskraadidel päikesevalguse hulk väheneb. Päevavalguse vähenemine suurendab käbinääre melatoniini tootmist. Melatoniini taseme tõus põhjustab liigset unisust, kehakaalu tõusu, väsimust ja depressiooni. SAD-i patsiendi kokkupuude kunstliku päikesevalgusega pärsib melatoniini tootmist ja parandab sümptomeid.
Jet lag on põhjustatud ööpäevarütmide häiretest, mis tulenevad pimeduse puudumisest, mis tekib siis, kui lennufirmade lennud üle ajavööndite häirivad käbinäärme ja melatoniini tootmist. Jet lag sümptomiteks on unetus, väsimus ja aju udu, kuigi melatoniini toidulisandite võtmine võib aidata ööpäevaseid rütme taastada. Öises vahetuses töötavatel töötajatel on jet lagiga sarnased sümptomid. Nende töötajate jaoks võib pimenduslintidega magamine aidata simuleerida öist aega ja kutsuda esile melatoniini tootmist.
Käbinääre ja melatoniini tootmine muutuvad vanusega. Melatoniini tootmine väheneb ja käbinäärmes tekivad kaltsifikatsioonid, mida nimetatakse ajuliivaks. Melatoniin on võimas antioksüdant ja osaleb ensüümi glutatioonperoksidaasi, teise antioksüdandi, soodustamises. Mõlemad antioksüdandid hoiavad ära vabade radikaalide tekitatud kahjustused. Kui melatoniini tase langeb, võivad sellest tulenevad vabade radikaalide kahjustused kaasa aidata vananemisele ja vanusega seotud haigustele.
Spetsiifilise sigimisperioodiga imetajatel kontrollib viljakust ka käbinääre ja melatoniini tase. Väljaspool sigimisperioodi ei tooda isased spermat, kuna kõrge melatoniini tase pärsib sugunäärmeid. Kevadel päevavalguse hulk suureneb, melatoniini tase langeb ja loom on uueks sigimistsükliks valmis. Inimestel ei esine hooajalist paljunemist, seega ei mõjuta melatoniini tase inimese viljakust.