Inimese immunoloogiaga seotud keemilised barjäärid on rasvhapped, valgud, kehaeritused ja muud looduslike omadustega ained, mis aitavad kaitsta keha haiguste või infektsioonide eest. Sellistel ainetel võivad olla antimikroobsed omadused, madal pH või need võivad lõhustada või destabiliseerida bakterirakke. Enamik neist barjääridest ei ole mõeldud immuunsüsteemi esmaseks kaitseks, vaid neil on sellised omadused sekundaarse funktsioonina. Vähesed eksisteerivad ainult immuunsüsteemi kaitsemehhanismina.
Inimkehal on palju süsteeme, mis kaitsevad võimalike ohtude või infektsioonide eest, sealhulgas kaasasündinud või kohandatud immuunsus, aktiivsed või passiivsed mehhanismid ning anatoomilised, humoraalsed või rakulised barjäärid. Keemiliste barjääride kategoriseerimise seisukohalt on sellised mehhanismid kaasasündinud, passiivsed ja kuuluvad anatoomiliste barjääride alla.
Kaasasündinud immuunsüsteemi osana on sellised barjäärid sündides sisse ehitatud. Teisisõnu, keha ei pea kohandama immuunsüsteemi, et võidelda infektsioonidega, kasutades neid barjääre, kuna need on olemas enne inimese esimest elupäeva. Keemiliste barjääride liigitamine passiivseteks näitab, et immuunsüsteemi abistamine on teisejärguline funktsioon. Anatoomiliste barjääritena esinevad nad pigem väljaspool kehakudesid kui rakutasandil.
Valgud, happed, sekretsioonid ja ensüümid, mis moodustavad keemilised barjäärid, toodetakse teatud esmaste ülesannete täitmiseks normaalsete või tahtmatute kehafunktsioonide osana. Näiteks toodab keha oma loomuliku jahutussüsteemi osana higi. Higistamine on ka passiivne barjäär inimese immuunsüsteemile, sest selle madal pH pärsib bakterite kasvu.
Teised kaitsemehhanismid hõlmavad sülge, pisaraid ja nina sekretsiooni. Need ained sisaldavad nii lüsosüümi kui ka fosfolipaasi – aineid, mis looduslikult lagundavad bakterirakkude välisseina ja rakumembraane. Sülje esmane eesmärk on seedimise soodustamine, kus pisarad ja ninaeritised aitavad võõrkehadest välja loputada ja kehamembraane niiskena hoida. Asjaolu, et need kemikaalid avaldavad negatiivset mõju ka ohustavatele bakteritele, on pigem kõrvalmõju kui esmane funktsioon.
Sisemised keemilised barjäärid kaitsevad ka infektsiooni eest, kui bakterid või muud ohud satuvad sisesüsteemidesse või organitesse. Kopsudes ja seedetraktis leiduvatel valkudel, mida tuntakse defensiinidena, on antimikroobsed omadused, mis tapavad teatud tüüpi baktereid. Teised seedetrakti kemikaalid konkureerivad nakkuslike rakkudega toitainete pärast või kinnituvad rakuseintele, näljutades kahjulikke või ähvardavaid rakke. Nagu higis leiduvatel rasvhapetel, on ka seedetrakti kemikaalidel madal pH, mis pärsib veelgi kahjulike bakterite kasvu kehas.