Amygdala ja hipokampus on aju limbilise süsteemi kaks osa. Mõlemal osal on esmased funktsioonid, mis on seotud mälestustega ja reaktsioonidega emotsionaalsetele aspektidele. Need kaks osa kui osa limbilisest süsteemist tervikuna käsitlevad seda, kuidas inimese aju neid emotsioone ja mälestusi töötleb.
Inimestel on keerulised ajud, mis on jagatud osadeks ja alamsektsioonideks. Igal neist osakondadest on oma kindlad funktsioonid ja eesmärgid. Üheskoos vastutab aju keha kõigi aspektide kontrollimise eest, alates liikumisest kuni hormoonide tootmiseni. Limbiline süsteem mängib käitumise ja emotsioonide kontrollimisel suurt rolli.
Limbilises süsteemis asuvad amügdala ja hipokampus hüpotalamuse all, mis on limbilise süsteemi teine osa, taalamuse vasaku osa lähedal. Üheskoos tegelevad need kaks osa peamiselt pikaajalise mälu moodustamisega, emotsioonide töötlemisega ja nende emotsioonide mälestustega seotud määramisega. Kuigi need kaks osa töötavad koos, on neil mõlemal oma kohustused.
Amygdalal on mitu funktsiooni. See kontrollib aju võimet koordineerida paljusid reaktsioone emotsionaalsetele stiimulitele. Nende hulka kuuluvad endokriinsed, autonoomsed ja käitumuslikud reaktsioonid. Stress, ärevus ja hirm on peamised stiimulid, mis tekitavad vastuseid. Amygdala vahendamine aitab kontrollida, kuidas need stiimulid kokku tulevad ja koordineerida.
Vastupidiselt mandelkeha funktsioonidele juhib hipokampus organismis kortikosteroidide tootmist, mis on kemikaalid, mis tekitavad stiimulitele füsioloogilisi reaktsioone. Hipokampus reguleerib ka seda, kuidas mõistus mälestusi loob. Lühiajalised mälestused kombineeritakse emotsionaalsete vastustega, et luua pikaajalisi mälestusi. Lisaks näitavad uuringud, et hipokampus toimib kaardina, luues inimese kogetava keskkonna paigutuse, mida nimetatakse kognitiivseks närvikaardiks.
Amygdala ja hipokampus toetuvad üksteisele oma individuaalsete funktsioonide kujundamisel. Stiimulitele reageerimist reguleerib amygdala ja neid vastuseid kasutab seejärel hipokampus nii lühi- kui ka pikaajaliste mälestuste moodustamiseks. Teatud sündmused on seotud nende sündmuste ajal kogetavate stiimulitega, mida töötleb amygdala ja millele pääseb juurde hipokampus.
Amygdala ja hipokampuse kahjustused võivad anda erinevaid tulemusi. Kui mandelkeha on kahjustatud ega saa korralikult toimida, võib inimesel tunduda emotsioonideta, sest stiimulitele ei reageerita. Hipokampuse vigastuse tulemused võivad varieeruda sõltuvalt kahjustatud küljest ja kahjustuse ulatusest. Üldiselt on mälufunktsioon muudetud. Alzheimeri tõvega patsientidel on sageli hipokampus kahjustatud.