Vaarikatorti saab valmistada mitmel viisil. Mõned kokad eelistavad kasutada koogipõhja jaoks tavalist pirukakoort, teised aga lehttainast või Grahami kreekerikoort. Tavaliselt tuleb koorik eelküpsetada. Vaarikad võivad olenevalt hapukoogi stiilist olla värsked või külmutatud. Üks kiire ja lihtne viis vaarikatorti valmistamiseks on valmistada vaarikapuding või vanillikaste. Teine võimalus on määrida vaarikamoosiga koorik ja peale panna värskeid marju.
Kuna enamikku vaarikatorte ei küpsetata, peab kokk enne koogi kokkupanemist kooriku pimedaks küpsetama, et see ei oleks toores tainas. Selleks, et kook küpsetamise ajal ei tõmbuks kokku, peaks kokk vooderdama koore alumiiniumfooliumi või küpsetuspaberiga ja katma kuivatatud ubade või pirukaraskustega. Raskused hoiavad kooriku all, et see ei saaks kuju kaotada ega paisuda.
Koduseid grahami kreekeri koorikuid tuleks samuti umbes 10 minutit eelküpsetada. Kokk ei vaja vaarikatorti valmistamisel grahami kreekerikoore jaoks pirukaraskusi. Kui ta kasutab lehttaigna, ei vaja ta ka raskusi, sest ta soovib, et tainas paisuks ja paisuks veidi.
Täidise valmistamine võib olla vaarikakoogi valmistamisel kõige olulisem osa. Täidis võib olla ükskõik milline, alates vaarikakreemist kuni vaniljepudingini, toorjuustupõhjast kuni vaarikamoositäidiseni. Täidisena vaarikamoosist koogi valmistamiseks peab kokk lihtsalt kooriku peale määrima ja seejärel lisama värskeid marju.
Vanillikreemitäidisega vaarikatorti valmistamisel katab kokk tavaliselt enne kreemi lisamist hapukoore õhukese moosikihiga. Tavaliselt kasutatakse aprikoosimoosi, kuna see on kahvatu, neutraalne värv. Moos moodustab tõkke keedukreemi ja kooriku vahele, vältides kooriku läbimärjaks muutumist.
Kui vaarikaid kasutatakse hapukale tervikuna, peaks kokk värskete marjade juurde jääma. Ta võib kasutada külmutatud marju, kui segada need vanillikaste. Värsked marjad peaksid olema suhteliselt ühtlase suurusega ja neil ei tohiks olla plekke, kuna neil on dekoratiivne eesmärk. Mõned kokad eelistavad katta kogu koogi ülaosa marjakihiga, teised asetavad marjad lihtsalt serva ümber. Marjade terav ots peaks olema ülespoole, et viljad oleksid tasakaalus ega kukuks ümber.