Apelsini koorega, apelsinimahla või apelsinimarmelaadiga valmistatud muffineid nimetatakse apelsinimuffiniteks. Apelsini koostisained muffinites on harva üksikud ja neid võib kombineerida selliste koostisosadega nagu jõhvikad, banaanid või šokolaad. Apelsinimuffineid süüakse sageli koos selliste jookidega nagu kohv. Seetõttu müüakse kohvikutes sageli oranže muffineid. Neid võib leida ka pagaritöökodadest või kodus valmistada.
Pärast apelsinikoore või -mahla lisamist apelsinimuffinitele muutub värvus oranžiks. See on normaalne; värvus muffinikorgidel ja muffinite sees on oranž. Mõned pagarid usuvad, et välimus on köögis sama oluline kui maitse, seetõttu jälgivad nad sageli, et need muffinid oleksid oranži tooniga. See on tavaliselt vähem oluline inimestele, kes küpsetavad kodus apelsinimuffineid.
Paljude apelsinimuffinite peamine koostisosa on apelsinikoor, mis ekstraheeritakse apelsini koorest. Pärast apelsini koorimist kraabitakse koore sees olev valge kiht ära. Ülejäänud väliskest nimetatakse kooreks. Kokad kasutavad seda meetodit apelsinikoorte saamiseks ja apelsiniliha säästmiseks muude retseptide jaoks. Teised kokad asendavad oma muffiniretseptides apelsinimahla või apelsinimarmelaadi apelsinikoorega.
Apelsinimuffinitele lisatud jõhvikad lisavad magusat maitset ja neutraliseerivad apelsinikoore või -mahla looduslikke suhkruid. Jõhvikate toitumisalased eelised annavad jõhvika-apelsini muffinitele tervisliku pöörde. Inimesed, kes tunnevad muret oma suupistete või maiuste terviseaspektide pärast, lisavad apelsinimuffinite valmistamisel sageli jõhvikaid.
Banaanid ja šokolaad aitavad tasakaalustada apelsini maitset, lisades apelsini karmimale maitsele pehme tekstuuri. Banaanid on õrnalt magusa maitsega, nii et nad imbuvad loomulikult muffini happelist maitset ja annavad maitsele rohkem looduslikke suhkruid, nagu ka šokolaad. Šokolaadi lisatakse sageli magusasõpradele sööjatele või lastele. Mõned šokolaadi-apelsinimuffinid sisaldavad pigem apelsinimarmelaadi moosi, mitte muffinisegu enda poolt pakutavat apelsinimaitset.
Marmelaadi lisatakse tavaliselt ka muud tüüpi apelsinimuffinite keskele, et maitsele magusust lisada. Marmelaad lisab muffinile endale niiskust; marmelaaditäidisega muffinit on keerulisem üle küpsetada. Marmelaadis sisalduvad looduslikud vedelikud küpsevad ümbritsevatesse koostisosadesse, luues niiskema keskpunkti. Pagarid võivad retsepti sisse segada ka marmelaadi, kas koos apelsinimahlaga või selle asemel.