Rottidel ja hiirtel on palju erinevusi ja sarnasusi. Konkreetsete erinevuste ja ühiste piirkondade kindlaksmääramine on keeruline, kuna mõlemat looma on mitut tüüpi. Tavaliselt võrreldakse neid kahte liiki, hinnates erinevusi toahiirte (Mus musculus) ja Norra või mustade rottide (Rattus norvegicus ja Rattus rattus) vahel. Neid võib nimetada ka lemmikloomadeks või hiirteks või iga liigi kodustatud versioonideks.
Hiired ja rotid ei saa ristuda, kuigi nad on sugulased. Evolutsioonibioloogid usuvad, et neil kahel liigil on esivanem, samamoodi nagu tiigrid ja gepardid. Iga loomatüüp arenes erinevalt, valides välja teatud omadused, mis näivad olevat ellujäämise tagamisel kõige rohkem abiks olnud.
Lihtsalt visuaalsest vaatenurgast märkate vahetut erinevust Norra või mustade rottide ja toahiirte vahel. Rotid on palju suuremad. Küpsusena kaaluvad nad umbes 12.35–22.93 untsi (350–650 g) ja nende kehapikkus on umbes 9–11 tolli (22.86–27.94 cm). Neil on pikad sabad, mille keskmine pikkus on 8 tolli (20.32 cm). Nende sabad on paksud ja rasked.
Hiir, vastupidi, võib olla kümnendiku roti kaalust ja kaalub umbes 1–1.76 untsi (30–50 grammi). Hiired on lühemad, umbes poole väiksemad kui rotid. Nende keskmine kehapikkus on umbes 3–4 tolli (7.62–10.16 cm) ja nende sabad võivad olla kehaga pisut ühtlasemalt tasakaalus, mõõtmetega umbes 3–4 tolli. Hiire sabad on väga õhukesed ja mõnikord vaevumärgatavad võrreldes palju laiema ja pikema roti sabaga.
Vähemalt ülalmainitud liikide rottide ja hiirtega võrreldes kipuvad rottide kõrvad olema nende peaga võrreldes väiksemad ning võivad tunduda suuremad ja nürimate näojoontega kui nende kaugetel sugulastel. Hiirtel on üldiselt õrnad näojooned ja teravamad näod kui rottidel. Kromosomaalsest seisukohast muutuvad erinevused veelgi silmatorkavamaks.
Kuigi rottide ja hiirte vahel on seos, on nende liigid mikroskoopilisel tasemel erinevad. Rottidel on rohkem kromosoomipaare, 22, võrreldes hiire 20 paariga. Lemmikloomadena koos hoituna võivad nad üksteisele probleeme tekitada. Rotid võivad tappa hiiri ja süüa hiiri, kõige sagedamini kodustamata tingimustes, ning rottide viibimine kodus võib hiirt tõsiselt häirida. Nad võivad sigida vähem või olla paanikas. Kui soovite lemmikloomaks nii rotte kui hiiri, peaksite kaaluma nende hoidmist eraldi ruumides.
Kui kaalute kumbagi looma lemmikloomana, on tavaliselt parem valik rotid. Tavaliselt on nad intelligentsemad ja suhtlevad inimestega paremini kui hiired. On erandeid ja mõned imelised hiired on olemas. Üldiselt aga osutuvad rotid paremaks ja kergemini koolitatavaks lemmikloomaks.
Need erinevused rottide ja hiirte vahel võivad olenevalt erinevatest võrreldavatest liikidest muutuda. Mõlemal on looduses üsna lühike eluiga, umbes 70% neist sureb enne aastaseks saamist. Vangistuses võib eluiga olla sarnane. Hiired võivad elada kauem, umbes viis aastat, kuid paljud surevad kahe kuni kolme aasta vanuselt. Rotid võivad vangistuses elada umbes kolm kuni neli aastat. Nende loomade lühike eluiga ei pruugi teha neist ideaalseid lemmikloomi väikelastele.