Pesa ja öömaja on kaks väga erinevat asja, kuigi linnud kasutavad mõlemat ja mõnel juhul kasutavad linnud mõlemat, olenevalt olukorrast ja vajadustest. Lihtsamalt öeldes on pesa ehitatud ruum, kus linnud saavad istuda või kükitada, samas kui öömaja on ahven, millest lind peab istumiseks haarama. Pesasid ja ööbimiskohti kasutatakse nii magamiseks kui ka röövloomade eest varjumiseks, kuid munade haudumiseks saab kasutada ainult pesa.
Kui linnud ehitavad pesa, koguvad nad materjale struktuuri loomiseks ja vooderdamiseks või olemasoleva ruumi vooderdamiseks. Olenevalt liigist võivad need materjalid sisaldada oksi, sulgi, rohtu, loomakarvu, paberijääke ja laia valikut muid asju. Paljud pesad on ehitatud varjatud aladele, mis võimaldavad lindudel pesal peituda. See on äärmiselt oluline, kuna pesasid kasutatakse munade haudumiseks.
Kui linnud sigivad ja toodavad mune, tuleb mune kuni koorumiseni soojas hoida. Tavaliselt tähendab see, et üks või mõlemad vanemad peavad teatud aja munadel istuma, võimaldades embrüotel areneda linnupoegadeks. Ilmselgelt ei suuda munad ahvenal balansseerida, mistõttu tuleb ehitada pesa, mis neid haudeperioodil kinni hoiaks ja linnupoegi kaitseks seni, kuni nad on piisavalt vanad, et lennata.
Öökoht seevastu on lihtsalt ahven. Paljud linnud magavad magama, lendavad puude otsa ja istuvad okstel ja okstel, et maapinnal kiskjate eest varjuda. Linnud viibivad ka öömajadel, et potentsiaalsel saagil silma peal hoida ja kiskjatele kättesaamatus kohas puhata. Tihti on pesa ja öömaja väga lähedal, pakkudes lindudele võimalusi sigimiseks ja poegade kasvatamiseks.
Veel üks oluline erinevus pesa ja öömaja vahel on see, et kuigi enamik linde ehitab erinevat tüüpi pesasid, siis mitte kõik linnud ei peesi. Ööda saavad ainult pääsulinnud, kuna neil on spetsiaalselt arenenud jalad, mis võimaldavad neil asjadest kinni hoida. Passeriinidel on kolm ettepoole suunatud varvast ja üks varvas, mis on suunatud teises suunas, luues klambri, mida saab kasutada lindu oksal hoidmiseks isegi magamise ajal, samal ajal kui teistel lindudel see võime puudub.