Varapõhine faktooring toimub siis, kui ettevõte müüb oma varad faktooringfirmale kohese tasu eest. Enamasti on kõne all olevate varade näol tegemist teiste ettevõtete maksearvetega, kes on saanud ärist kaupa kohe tasumata. Faktooringfirma kannab suure protsendi arvel olevast summast ettevõttele ette ja maksab ülejäänud osa välja, millest on maha arvatud väike allahindlustasu, kui ta on võlgnikult kogu makse kätte saanud. Kasutades varapõhist faktooringut, saavad ettevõtted tagada püsiva rahavoo, ilma et nad peaksid taluma ärilaenu taotlemisega kaasnevaid krediidikontrolli.
Ettevõtte jaoks on ülioluline, et ta leiaks viise raha teenimiseks, et igapäevast tegevust toetada. Seda sularaha võib olla raske hankida, eriti kui sellel on krediidisuhted teiste ettevõtetega, kellega ta äri teeb. Üks võimalus ettevõttel vältida rahavooprobleeme, mis on seotud pikkade ajavahemikega kauba kohaletoimetamise ja võlgnike maksete vahel, on varapõhine faktooring, mis hõlmab kolmanda osapoole faktooringufirmat, mis teeb sularaha ettemakseid ja kogub makseid.
Näitena varapõhise faktooringu toimimise kohta kujutage ette, et ettevõte A müüb toote ettevõttele B 2,000 USA dollari (USD) eest ja ettevõte B kavatseb maksta ettevõttega A sõlmitud krediidilepingu alusel. Seejärel võtab ettevõte A ühendust faktooringuga. ettevõte, kes on nõus arve ostma ja ettevõttele A 80 protsenti summast ette tasuma. Ülejäänud osa hoiab faktooringfirma reservis seni, kuni ta saab ettevõttelt B makse sisse nõuda. Pärast makse laekumist maksab faktooringfirma ülejäänud summa ettevõttele A, millest on maha arvatud 5-protsendiline allahindlustasu.
See tähendab, et ettevõte A saab faktooringfirmalt kohe 1,600 USD suuruse makse. Kui ettevõte B maksab faktooringuettevõttele ära, saab ettevõte A 300 USD rohkem, mis on reservsumma, millest on lahutatud 5-protsendiline allahindlustasu. Faktooringuagentuur saab oma teenuste eest allahindlustasu, mis on 100 USD.
See, kui palju faktooringfirma varapõhise faktooringlepingu sõlmimisel ettemakse teeb ja milliseid tasusid ta küsib, sõltub mitmest tegurist. Tõenäoliselt kontrollib faktooringfirma enne tasude kehtestamist ettevõtte võlgnike krediidivõimet ja ettevõtte äritegevuse mahtu. Lisaks võib lepingu olemus määrata tasu ja ettemaksu määrad. Täpsemalt, kui ettevõtet ei peeta lepingu kohaselt vastutavaks võlgnike krediidiriski rikkumiste eest, on faktooringfirma võetavad tasud suhteliselt kõrged.