Ülikooli organisatsiooniline struktuur viitab hierarhiale, mille kaudu toimub kohustuste delegeerimine. See annab töötajatele ja õpilastele aimu, kes kellele vastab ja kelle poole pöörduda, kui probleem peaks tekkima. Ülikooli konkreetne organisatsiooniline struktuur võib olenevalt asutusest erineda, kuigi enamikul juhtudel on juhtimistase organisatsiooniredeli kõrgeim aste. See tase hõlmab kolledži või ülikooli presidenti, samuti kantslerit, kui see on olemas, ja direktorite nõukogu, kui need on olemas. Teiste selle tasandi ametikohtade hulka kuuluvad laekurid ja praostid, samuti asepresident või asepresidendid.
Kui enamikul juhtudel on kolledžis või ülikoolis ainult üks president, võib ülikooli organisatsioonilises struktuuris olla mitu asepresidenti. Need asepresidendid võivad väiksemates ülikoolides vastutada mitmesuguste ülesannete eest, samas kui palju suuremates ülikoolides võivad nad tegeleda ainult ühe või kahe konkreetse kolledži funktsioonivaldkonnaga. Näiteks üliõpilasasjade asepresident tegeleb peamiselt üliõpilaste tegevuste, probleemide, saavutuste ja eelarveprobleemidega. Rahanduse asepresident tegeleb eranditult ülikooli rahaasjadega ja tema pädevus võib ulatuda kõigi ülikooli osakondadeni.
Akadeemilised dekaanid on ülikooli organisatsioonilise struktuuri erinevate osakondade juhid. Näiteks inglise keele osakonnas on dekaan, kes sisuliselt juhib või muul viisil jälgib selle osakonna kõiki funktsioone. Bioteaduste dekaan juhib ülikoolis konkreetset teaduste osakonda ja meditsiinidekaan jälgib kõiki ülikooli pakutavaid meditsiiniprogramme. Dekaan võib ülikooli struktuuris olla ka muudel ametikohtadel, kuigi see pole mõnes koolis tavaline. Programmidel võivad olla ka assotsieerunud dekaanid, kes vastavad dekaanile; need inimesed vastutavad osakonna juhtimisel abistamise ja osakonna ees seisvate konkreetsete probleemide lahendamise eest.
Ülikooli organisatsiooniline struktuur võib sealt edasi areneda, hõlmates muid programme, nagu kergejõustikuprogrammid, maastikuhooldus, üliõpilasomavalitsus, elamuosakonnad ja palju muud. Konkreetne koht nende ametikohtade hierarhias võib erineda vastavalt konkreetse ülikooli prioriteetidele. Paljudel juhtudel võib struktuuri prioriteetide muutmiseks toimuda ümberkorraldamine, et raha eraldataks õigesti ja staažiga arvestataks õigesti. Organisatsiooni ümberstruktureerimine võib olla keeruline ja stressirohke kõigile ülikooli struktuuri liikmetele, mistõttu on sageli kõige parem leida toimiv süsteem ja sellest kinni pidada.