Trüptooni kasutatakse mikrobioloogias bakterite kasvatamiseks. Seda toodetakse teatud piimas leiduvast ainest. Trüptoon sisaldab palju lämmastikku, mida bakterid vajavad kasvamiseks. Kuna see on rikkalik toitainete allikas, saab seda erinevate mikrobioloogiliste söötmete valmistamiseks segada teiste kemikaalidega. Tavaliselt müüakse seda kuivpulbrina.
Suurem osa piimas leiduvast valgust on aine nimega kaseiin. See valk sisaldab palju lämmastikku, mis on bakterite kasvu jaoks hädavajalik. Kaseiini võivad ensüümid lagundada, moodustades uusi molekule. Need uued lagunemissaadused sisaldavad palju metaboolselt kasulikke materjale ja ühiselt nimetatakse neid trüptooniks. Lisaks lämmastiku-, vitamiini- ja aminohapperikkale ning seetõttu bakterite kasvule kasulikule tootele sisaldab see trüptofaani ja väga vähe süsivesikuid.
Mikrobioloogid tuvastavad ja uurivad mikroobe, näiteks baktereid. Selleks peavad nad võtma proove toidust, tootest või keskkonnast, mida nad soovivad uurida. Üks võimalus seda teha on asetada proov söötmele, näiteks agarile või puljongile, mis sisaldab toitaineid proovis olevate bakterite jaoks. Seejärel hoitakse inokuleeritud söödet teatud aja jooksul teatud temperatuuril. See võimaldab bakteritel paljuneda, nii et nende olemasolu on võimalik palja silmaga jälgida või et neid oleks piisavalt, et reageerida biokeemilistele või geneetilistele testidele.
Bakterid jaotatakse rühmadesse sõltuvalt nende toidu- ja keskkonnanõuetest. Tundmatu mikroobi teatud omaduste tuvastamine võimaldab mikrobioloogil kitsendada võimalikke rühmi, kuhu bakter kuulub. Erinevate bakterirühmade üksteisest eristamiseks kasutab mikrobioloog spetsiifilisi söötmeid, mis võimaldavad mõnel bakteril kasvada ja takistavad teiste paljunemist. Trüptooni trüptofaani komponent soodustab bakterite kasvu, mis toodavad teatud kemikaali, mida nimetatakse indooliks. Mikrobioloog saab seejärel oma proovis tuvastada indooli tootvad bakterid.
Süsivesikute puudumine tootes tähendab, et seda saab kasutada ka bakterite tuvastamiseks selle järgi, kuidas nad eri tüüpi süsivesikuid lagundavad. Trüptoonipulber segatakse teatud tüüpi süsivesikutega. Kasv söötmes näitab liigi olemasolu, mis võib selle konkreetse molekuli lagundada.
Kaubanduslikku trüptooni müüakse kuiva pulbrina, mida saab hoida laboris, kuni see on vajalik kandja valmistamiseks. See võib olla ka valmis meediatoodete, näiteks trüptoon-sojaagar ja trüptoon-sojapuljong, koostisosa. Sellel võivad kergesti kasvada sellised bakteriliigid nagu Escherichia coli ja Staphylococcus aureus.