Skvaleen on looduslik molekul, mida toodavad inimesed ja paljud teised organismid. Inimesed vajavad seda oluliste ühendite, näiteks hormoonide, toorainena ning seda võib leida mõnes toidus, kosmeetikas ja farmaatsiatoodetes. Kaubanduslikult ekstraheeritakse seda tavaliselt haide ja muude kalamaksadest. Kõrge ühendi sisaldusega dieedid võivad samuti alandada kolesterooli. Maailma Terviseorganisatsioon (WHO) ega USA Toidu- ja Ravimiamet (FDA) ei toeta muret, et aine lisamine vaktsiinidesse on tervisele ohtlik.
Loomad, sealhulgas inimesed, toodavad seda ainet maksas. See liigub vereringes ringi ja keha kasutab seda vajalike hormoonide ja muude ühendite tootmiseks. Kolesterool on vaheaste skvaleeni ja molekulide, nagu östrogeen, kortisool ja isegi D-vitamiin, vahel.
See konkreetne molekul leostub kehast välja ka meie sõrmejälgedega. Kalade, näiteks haide, maks on materjali rikas ja see on koht, kus tööstused otsivad oma allikaid. Lisaks maksale leidub seda ka munades, lihas ja pärmis.
Seda ainet toodavad ka taimed. Näiteks oliiviõli sisaldab 0.7% skvaleeni. Vahemere äärsete riikide oliiviõlirikka dieediga seotud kasu tervisele võib tuleneda sellest õli omadusest. Tervisliku toiduga tegelevad ettevõtted müüvad seda “haimaksaõlina”. Mõned kosmeetikatooted sisaldavad seda materjali, nagu ka mõned ravimid.
FDA andmetel on skvaleeni kontsentratsioon veres üldiselt 250 osa miljardi kohta (250 nanogrammi milliliitri kohta). WHO ega FDA ei ole 2011. aasta seisuga põhjendanud muret, et vaktsiinides sisalduv skvaleen põhjustab terviseriske. WHO sõnul annab konkreetne Euroopa riikides manustatav vaktsiin koos antigeeniga 10 milligrammise skvaleeni doosi. ja et sellel vaktsiinil ei ole olnud tõsiseid kõrvaltoimeid alates selle esmakordsest valmistamisest 1997. aastal.
Seda materjali kasutatakse mõnes vaktsiinis, et aidata immuunsüsteemil vaktsineerimist tõhusamalt ära tunda. Iseenesest ei ole see tõhus, kuid kui see on segatud emulsiooniks teiste ainetega, siis on. Üks probleem, mis vaktsiinitöötajatel on skvaleeniga seotud, on see, et sõduritel, kellele oli süstitud siberi katku vaktsiini ja kellel tekkisid hiljem terviseprobleemid, ilmnesid veres selle aine vastased antikehad. Nüüd on aga teada, et kõigil on skvaleenivastased antikehad, mis vanusega suurenevad, ja et kõnealune siberi katku vaktsiin ei sisaldanud algselt seda ainet. Testid, mis näitasid madalat skvaleenisisaldust vaktsiinides, võisid olla saastunud laboratoorsete klaasnõudega, millel on sõrmejäljed.