Mis on SiRNA?

SiRNA ehk väike segav ribonukleiinhape on teatud tüüpi RNA, mis osaleb mitmetes bioloogilistes protsessides, eelkõige RNA interferentsis. RNA interferents on regulatiivne protsess, mida kasutatakse mõne geeni ekspressiooni kontrollimiseks ja piiramiseks. Kuigi enamik RNA-d on üheahelalised, koosneb siRNA kahest komplementaarsest nukleotiidide ahelast, mis on sarnased DNA omadega, mis on esmane bioloogiline üksus geneetilise teabe salvestamiseks. Kaheahelalise RNA üks ahel võib seostuda messenger-RNA-ga, et inhibeerida selle rolli valgusünteesis, piirates seeläbi konkreetse geeni ekspressiooni. Väikest segavat RNA-d nimetatakse mõnikord ka vaigistavaks või lühikeseks segavaks RNA-ks.

SiRNA osaleb peamiselt RNA interferentsi regulatiivses protsessis. Pikad kaheahelalised RNA ahelad lõikab ensüüm, mida nimetatakse diceriks, palju lühemateks ahelateks. Seejärel eralduvad kaks kiudu; üks laguneb, samas kui teine ​​on integreeritud RNA-indutseeritud vaigistamiskompleksi, mis koosneb erinevatest valkudest ja ühest siRNA ahelast, mida nimetatakse juhtahelaks. Juhtahelat kasutatakse spetsiifilise RNA ahela äratundmiseks, mida kompleks kavatseb segada, või “vaigistada”. Valgukompleks lõikab sihitud RNA ahela, takistades seeläbi selle translatsiooni valguks.

SiRNA-st juhitud RNA interferents on oluline tööriist, mida kasutatakse paljudes erinevates bioloogialaborites, kuna see suudab sihtida ja pärssida spetsiifiliste geenide ekspressiooni. Teadlased seisavad aga silmitsi paljude probleemidega, rakendades RNA interferentsi tõhusa uurimismeetodina. Lühikesed siRNA ahelad seostuvad mõnikord mittetäielikult valede RNA järjestustega, nii et mittespetsiifiline seondumine on mõnikord probleem. Lisaks toimivad paljud erinevad viirused kaheahelalise RNA kaudu, nii et organismi immuunsüsteem võib siRNA-d ära tunda kui ohtu ja tekitada selle vastu immuunvastuse. Nendest probleemidest hoolimata on teadlased suutnud kasutada RNA interferentsi, et oluliselt vähendada antud geeni ekspressiooni, et määrata kindlaks kõnealuse geeni täpne funktsioon.

Erinevate organismide, sealhulgas taimede, imetajate ja putukate immuunsüsteemid sõltuvad tegelikult teatud määral RNA sekkumisest. See kehtib eriti siis, kui organism peab võitlema viirusinfektsiooniga. RNA-indutseeritud vaigistamiskompleks võib viiruse RNA-d sihtida ja deaktiveerida, et vältida selle peremeesorganismi kahjustamist. Kuigi siRNA ja RNA interferentsi rollid on taimedes ja mõnedes teistes organismides hästi mõistetavad, on RNA täpne seotuse tase imetajate immuunsüsteemis endiselt halvasti mõistetav.