Serotoniini transporter on lahutamatu membraanivalk, mida leidub inimajus rohkesti. See viib neurotransmitteri serotoniini sünapsivahelisest ruumist, sünaptilisest pilust, presünaptilisse neuronitesse. Seda tehes lõpetab see meeleolu stabiliseeriva neurotransmitteri tegevuse ja taaskasutab selle. Aju neuronid suhtlevad omavahel serotoniini ja sarnaste ainete abil. Selle konkreetse valgu olemasolu reguleerib serotoniini kontsentratsiooni sünapsis ja serotoniini transportersüsteemi muutustel või häiretel on suur mõju erinevatele vaimse tervise probleemidele.
Enim mõjutatud on psühhiaatrilised häired, mis tegelevad meeleolu ja impulsside kontrolliga. Mõned spetsiifilised seisundid hõlmavad kliinilist depressiooni, üldist sotsiaalfoobiat, alkoholismi ja ainete kuritarvitamist, traumajärgset stressihäiret (PTSD) ja obsessiiv-kompulsiivset häiret (OCD). Jätkuvad uuringud serotoniini transportersüsteemi kohta näitavad selle olulist rolli ka muudes häiretes. Seos on loodud geeni, mis vastutab serotoniini transporteri tootmise eest, serotoniini transporteri geeni (SERT) ja vastuvõtlikkuse vahel nendele häiretele. Geen on saadaval kahes pikkuses ehk kahes “alleeli” ja inimesel, kellel on isegi üks lühike versioon, on suurem risk seotud vaimse tervise probleemidega.
Alleeli pikal versioonil on korduv nukleotiidjärjestus, mis teeb rohkem serotoniini transportereid. See viib lõpuks selleni, et neuronid ja teised keha serotonergilised rakud saavad kasutada rohkem serotoniini. Uuringud näitavad, et inimene, kellel on kaks pikka alleeli, suudab kasutada kuni kaks korda rohkem serotoniini kui inimene, kellel on kaks lühikest alleeli. Inimese DNA-s esineva SERT-i geneetilise variandi kindlaksmääramine on paljutõotav, et määrata kindlaks, millist lähenemist kasutada seotud psühhiaatrilise häire ravis.
Serotoniini metabolism konkreetses ajupiirkonnas, mandelkehas, mida soodustab serotoniini transportersüsteem, määrab suuresti selle, kuidas inimene hirmule reageerib. Keha reaktsioon hirmule on seotud paljude eelnimetatud häiretega. Kliinilist depressiooni, kogu maailmas levinud haigusseisundit, on sageli põhjustanud hirmust tulenevad pikaajalised negatiivsed emotsioonid. Uuringud näitavad, et üldine sotsiaalfoobia ja mitmesugused muud ärevushäired tulenevad sotsiaalsete sündmuste aju vigasest või liialdatud tõlgendamisest. Amygdala vastutab hirmusignaalide tõlgendamise eest sotsiaalsetes olukordades ja serotoniini transporterite puudumine aitab kaasa ajupiirkonna ülereageerimisele sellistes olukordades.