Vaimne puue ja vaimne tervis on kaks probleemset valdkonda, mis sageli põimuvad. Intellektuaalse häirega inimesed on sageli vastuvõtlikumad teatud vaimse tervise häiretele, nagu depressioon. Omakorda võivad mõned vaimse tervise vaevused olla ühised intellektipuudega. Kuna igal vaimsel või kognitiivsel kahjustusel võivad olla sarnased põhjused või need võivad põhjustada sarnaseid tulemusi, võivad vaimupuude ja vaimse tervise häirete ravimeetodid ühineda.
Vaimsed häired tekivad siis, kui emotsionaalse taju ja käitumise kõrvalekalle põhjustab pikaajalist stressi ja häireid inimese igapäevases toimimises. On olemas suur hulk vaimseid häireid, sealhulgas isiksusehäired, ärevushäired ja meeleoluhäired. Need häired tekivad sageli geneetiliste ja keskkonnategurite kombinatsioonist.
Vaimse puude tunnused hõlmavad tavaliselt mõtlemise, mõistmise ning keerukate probleemide lahendamise ja analüüsimise häireid. Nendel puuetel on ka lai klassifikatsioonisüsteem, mis ulatub vaimsest alaarengust õpiraskusteni. Geneetilised kõrvalekalded, sünnidefektid ja ajuvigastused soodustavad sageli intellektipuude teket.
Teadlaste hinnangul on tervelt kolmandikul kuni pooltel vaimupuudega inimestest ka vähemalt üks psüühikahäire. Näiteks üks seisund, mis võib esineda koos intellektuaalse häirega, on skisofreenia. Tegelikult jäljendavad skisofreenia varased näitajad sageli intellektipuude ilminguid: mäluhäired, tähelepanuhäired ja aeglustunud teabetöötlusvõime. Pervasiivsetel arenguhäiretel, nagu autism, on sarnane seos vaimupuudega. Teaduslike tõendite kohaselt võivad sarnased geneetilised ja neuraalsed kõrvalekalded olla aluseks nii vaimupuudele kui ka vaimse tervise häiretele, nagu skisofreenia ja autism.
Vaimupuuded ja sellest tulenev keskkonnastress võivad muuta inimese haavatavamaks ka teatud psüühikahäirete suhtes. Ärevushäired ilmnevad äärmise mure ja obsessiivsete mõtetega võimalike negatiivsete tagajärgede kohta. Õppimishäire või sarnase intellektipuudega inimene võib sattuda suuremasse ja pikemaajalisemasse agitatsiooniseisundisse, kui rutiinseid intellektuaalseid ülesandeid ei suudeta täita keskmise tempoga. Frustratsioon võib põhjustada ka inimese tuju kurvemaks muutumist, mis võib tekitada lühiajalise depressiivse episoodi, mis võib areneda üldiseks depressiooniks.
Paljud raviprotokollid võivad vaimupuude ja psüühikahäirete puhul kattuda. Kognitiivsed teraapiad, mis käsitlevad muutunud ja valesid mõttemustreid ja püüavad neid parandada, on erinevates psühholoogilistes ravimeetodites tavalised. Konkreetseid käitumisülesandeid rakendavad käitumisteraapiad liidetakse sageli kognitiivsete lähenemisviisidega, luues usaldusväärse raviprotokolli vaimupuude ja vaimse tervise häirete topeltdiagnoosimiseks. Traditsiooniline vestluspõhine nõustamine võib aidata inimestel leevendada muret ka mitmesuguste kognitiivsete ja emotsionaalsete probleemide pärast.