Kuigi on palju asju, mis võivad põhjustada seedehäireid, mängib sageli rolli stress. Kui inimesel on näiteks seedehäirete sümptomid, võib stress neid halvendada. Mõnel juhul võib stress isegi põhjustada seedehäireid, häirides hormoone ja närvisüsteemi signaale, mis on seotud toidu seedimisega. Selle tulemusena võivad inimesel tekkida seedehäired, kui ta tunneb stressi.
Paljud inimesed arvavad, et stress on ainult vaimne probleem, kuid sellel võib olla ka füüsiline mõju kehale. Sellisena võivad stress ja seedehäired käia käsikäes. Sageli märgib inimene, kes kogeb emotsionaalset stressi, ka seda, et tal on iiveldus või kõhuvalu. See on tingitud asjaolust, et stress põhjustab tavaliselt kehas muutusi, mis põhjustavad tõelisi seedehäirete sümptomeid.
Stress ja seedehäired on omavahel seotud organismi tüüpilise stressireaktsiooni tõttu. Kui inimene tunneb stressi, hakkab närvisüsteem reageerima, mis võib põhjustada seedehäireid või vähemalt sellele kaasa aidata. Näiteks adrenaliin vabaneb kehasse sageli vastusena stressile, nagu ka kortisool ja teised stressiga seotud hormoonid. See on normaalne kaitseprotsess kehas, kuid sellel võib olla negatiivne mõju inimese seedimisele. Püüdes keha ette valmistada tajutava ohuga toimetulemiseks, võivad stressihormoonid aeglustada kehas mittekriitilisi protsesse, nagu seedimine, mille tulemuseks on seedehäired.
Kui inimese stressitase põhjustab seedehäireid, võib teda vaevata rohkem kui lihtsalt iiveldus. Inimene, kes tegeleb stressi ja seedehäirete tagajärgedega, võib samuti tunda, et tal on puhitus, kõrvetised või tekib vajadus gaaside vabastamiseks röhitsemise ja kõhugaaside näol; mõned inimesed võivad märgata ka happelist maitset suus. Mõnel juhul tekib inimesel kõhulahtisus stressiga seotud seedehäirete sümptomina. Näiteks võib stressis õpilasel tekkida kõhulahtisus vahetult enne olulist eksamit. Mõnel juhul on stressist tingitud seedehäired isegi piisavalt tõsised, et põhjustada oksendamist.
Kuigi seos stressi ja seedehäirete vahel on ebameeldiv, võib kroonilise stressiga inimene muretseda rohkem kui kõhuhäda pärast. Kroonilise stressiga inimesel võib olla nõrgenenud immuunsüsteem ja nad võivad olla altimad nii lühi- kui ka pikaajalistele seisunditele. Näiteks võib inimesel, kes on pikka aega suure stressi all, olla suurem risk haigestuda külmetushaigustesse, grippi, haavanditesse, ärevusse ja depressiooni. Tegelikult võib krooniline stress isegi suurendada inimese südameinfarkti riski.