Pankreas ja kaksteistsõrmiksool on üksteisega ühendatud kanalite süsteemiga ja on seedeprotsessi jaoks olulised. Endokriinnäärmena sekreteerib kõhunääre hormoone ja seedeensüüme, mis kombineeritakse teiste kaksteistsõrmiksoole kemikaalide ja sekretsioonidega, et aidata seedimist. Kuna kõhunääre ja kaksteistsõrmiksool on nii tihedalt läbi põimunud, mõjutavad ühte neist struktuuridest mõjutavad haigusseisundid tõenäoliselt ka teist. Mõned kõige levinumad probleemid, mis mõjutavad mõlemat elundit, on kõhunäärmevähk, divertiikulid ja pankreatiit. Kaksteistsõrmiksoole haavandid ja infektsioon võivad samuti põhjustada probleeme nii kõhunäärmes kui ka kaksteistsõrmiksooles.
Pankreas, mis asub vahetult mao taga, on suurim endokriinsüsteemi kuuluv organ. See nääre vastutab selliste hormoonide nagu glükagooni ja insuliini vabastamise eest kehasse ning toodab ka seedeensüüme, mis aitavad seedimise käigus toiduosakesi ja muid aineid lagundada. Kaksteistsõrmiksool on peensoole lühim osa ja on kõhunäärmega ühendatud kanalite süsteemiga. Osaliselt seeditud materjalid sisenevad kaksteistsõrmiksoole, kus need ühinevad kõhunäärme ja teiste organite seede sekretsioonidega, et jätkata seedimisprotsessi.
On mitmeid haigusprotsesse, mis võivad mõjutada nii kõhunääret kui ka kaksteistsõrmiksoole. Pankrease vähk või peensoole vähk võib avaldada negatiivset mõju mõlemale struktuurile. Vähirakud võivad levida kanalitesse, mis ühendavad elundeid üksteisega. Kui vähirakud avastatakse enne levikut, võib kasvaja olla võimalik eemaldada enne ulatusliku kahjustuse tegemist. Kui vähk on levinud mitmesse piirkonda, võivad osutuda vajalikuks täiendavad ravimeetodid, nagu keemiaravi või kiiritus.
Kaksteistsõrmiksoole divertikulaar on meditsiiniline termin, mida kasutatakse ebanormaalse koti tekke kirjeldamiseks peensoole kaksteistsõrmiksoole osas. Kui see kotike nakatub või kui tekib sooleummistus, võib see mõjutada ka kõhunääret. Pankreatiit, kõhunäärme põletik, on kaksteistsõrmiksoole divertiikulite tavaline tüsistus, kuigi sellel võib olla ka muid põhjuseid. Soolehaavandid võivad samuti põhjustada põletikku või nakkuslike materjalide liikumist kaksteistsõrmiksoolest kõhunäärmesse. Tugevat kõhuvalu, eriti kui sellega kaasneb iiveldus, oksendamine või palavik, peab arst hindama, et välistada võimalikud tõsised kõhunäärme ja kaksteistsõrmiksoolega seotud tüsistused.