Mis on RNA polümeraas II?

Ribonukleiinhappe (RNA) polümeraas II käivitab transkriptsiooniprotsessi, mis kopeerib DNA-d, seondudes geeni osaga. Polümeraas on ensüüm, mis toimib katalüsaatorina uue DNA ja RNA moodustamisel olemasolevast DNA või RNA ahelast. RNA polümeraas II (RNAP II) transkribeerib kõik rakus olevad ribonukleiinhappe (mRNA) molekulid. Seda tuntakse ka kui Poll II.

RNA polümeraas II käivitab keemilise reaktsiooni. See toimib, avades esmalt DNA molekuli osa. Seejärel kerib see lahti ja tõmbab lahti DNA kaksikheeliksi, jagades selle kaheks ahelaks sarnaselt tõmbluku lahtivõtmisega. Seejärel võimaldab polümeraas kõigi rakusiseste mRNA molekulide transkriptsiooni või kopeerimist.

Nukleotiide võib võrrelda tõmbluku hammastega. Kui kaks DNA ahelat on eraldatud, hakkab moodustuma uus RNA ahel, kuna RNA polümeraas II sobitab komplementaarsed nukleotiidid ühe DNA ahelaga, luues seega RNA ahela, mis jäljendab teist DNA ahelat. Tulemust võib võrrelda RNA-DNA tõmblukuga. Seejärel “tõmmatakse” äsja moodustunud RNA ahel DNA ahelast lahti ja see väljub polümeraasist. DNA ahelad ühinevad uuesti ja polümeraas jätkab liikumist DNA ahela pikkuses, korrates seda protsessi.

Mõnikord on protsess häiritud. Viirused, mis muudavad geeniekspressiooni, teevad seda sageli RNA polümeraasi II transkriptsiooniprotsessi väljalülitamisega. Näiteks on leitud, et mõnel juhul inhibeerib ja hävitab gripiviirus seda konkreetset polümeraasi.

Üks mitmest makromolekuli tüübist, RNA polümeraas II on tegelikult suur kompleks, mis koosneb 10 erinevast valgu alamühikust. See transkribeerib messenger-RNA-sid ja mitut väikest tuuma-RNA-d. See on vaid üks mitmest polümeraasi tüübist.

RNA polümeraas II erineb RNA polümeraas III-st, mille funktsioon on enamasti rakkude kasvu reguleerimine. Teine oluline erinevus seisneb selles, et DNA polümeraasid ei saa algatada uut ahelat, kuid RNA polümeraas saab seda teha. RNA-d siduv valk (RBP) võib olla võtmetegur RNA polümeraas II kontrollimisel ja reguleerimisel.

Polümeraasi abil transleeritakse rohkem kui ühte tüüpi RNA-d. Messenger RNA (mRNA) transleeritakse polüpeptiidiks. RNA polümeraasi II kasutatakse ülekande-RNA (tRNA) transkribeerimiseks, mis kannab aminohapped kasvavale polüpeptiidile. Seda kasutatakse ka ribosomaalse RNA (rRNA) transkribeerimiseks, mida kasutatakse raku ribosoomide ehitamiseks.