Varjupaik on ülejäänud akvaariumipopulatsioonist eraldatud sektsioon, mis võib asuda kas paagi sees või väljaspool. Varjupaiga eesmärk, nagu selle nimigi viitab, on pakkuda pelgupaika kaladele ja muule vee-elustikule. Varjupaigal on aga samad veetingimused kui ülejäänud akvaariumil, mistõttu on see ideaalne omadus, kui eesmärk on vabastada isoleeritud liigid lõpuks põhipaaki.
Varjupaigast võib olla kasu, kui mõni vee-elustiku liik, näiteks kala, on vigastatud ja võib vajada erilist kaitset akvaariumi agressiivsete liikide eest. Sageli on vigastatud kala rünnaku peamine sihtmärk. Parim viis nende kalade taastumise ajal ohutuks hoidmiseks on hoida neid isoleerituna. Mõne akvaariumiomaniku jaoks on see väga oluline, sest mõned eksootilised kalaliigid võivad olla üsna kallid.
Pelgupaika saab kasutada ka saaklooma isolatsiooni hoidmiseks, kuni see on valmis kalapopulatsioonile tarbimiseks esitama. See võimaldab saagil veega kohaneda; mõned kalad, kes jätavad selle kohanemisprotsessi vahele, on vette sattudes šokis ja surevad enneaegselt. See ei pruugi tunduda probleemina, kuna saak süüakse niikuinii, kuid mõned spetsiaalselt röövloomade jaoks kohandatud kalaliigid ei söö juba surnud saakloomi. Seega võib varjupaik mõnel juhul olla akvaariumi üldise tervise jaoks väga oluline.
Refugiumid erinevad enamikust teistest akvaariumi jagajatest ja eraldajatest. Tavakeeles kasutavad mõned seda terminit akvaariumi mis tahes jagaja või eraldaja tähistamiseks. Siiski peetakse enamikku pelgupaikadest selliseks ainult siis, kui neil on eraldi sektsioon, mis asub väljaspool peamist akvaariumi.
Lisaks akvaariumirakendustele saab refuuge kasutada ka vesiviljeluses. Sellistes olukordades jagavad kõik varjupaigaüksused sama veevoolu, kuid iga varjupaik võib selle veega midagi veidi erinevalt teha. Näiteks võivad teatud liigid mõnel juhul vajada aeglasemat voolu. Teised liigid võivad vajada kiiremat voolu. Refugiumid võivad aidata seda reguleerida. Tuleb märkida, et refugiume kasutatakse sageli nii taimede kui ka loomade jaoks.