Punane klorofüll on haruldane punane pigment, mida leidub väga väikeses protsendis meretaimedest. Nagu roheline klorofüll, võimaldab see taimedel neelata valgust, et alustada fotosünteesi, protsessi, mille käigus taimed muudavad energia toiduks. Punast klorofülli sisaldavad taimed kuuluvad tavaliselt tsüanobakterite kategooriasse või mikroskoopilistesse taimede kategooriasse, mis kasvavad väikestes kolooniates korallriffidel ja paiksetel mereloomadel, näiteks merepritsmed.
Üks konkreetne tsüanobakteriliik sisaldab punast klorofülli, mida klassifitseeritakse ka klorofüll d või klorofüll f. Need tsüanobakterid, mida nimetatakse Acaryochloris jahisadamaks, on punase värvusega, muutes need erinevaks ülejäänud liikidest. Vanad kreeklased andsid tsüanobakteritele oma nime, kuna tsüano tähendab “sinakasrohelist”. Acaryochloris marina ei jaga seda värvitunnust, kuid jagab sama rakustruktuuri, kasvumustreid ja keskkonnavajadusi nagu ülejäänud liikidel. Selle klorofülliga täidetud tsüanobakterid võivad kasvada ka madalamal sügavusel kui tema sinakasrohelised nõod.
See meretaimestik on valgusspektris punane, kuna see neelab infrapunavalgust valgusspektri äärmises otsas ja peegeldab nähtavat punast valgust. Infrapunavalguse lainepikkused on palju pikemad kui nähtava spektri lainepikkused, võimaldades neil tungida sügavale ookeani. Enamik teisi tulesid, eriti spektri lühikese otsa sinised ja lillad, filtreeritakse vette levivast valgusest välja. Kui Acaryochlorise jahisadam ei suudaks infrapunavalgust neelata, ei saaks see ellu jääda.
Punast klorofülli on kahte tüüpi: klorofüll d ja klorofüll f. Esimene tüüp neelab infrapunavalgust, mis asub väljaspool nähtavat spektrit, mõõtes üldiselt 700 lainepikkust või rohkem. Teine sort neelab infrapunavalgust lainepikkuste vahemikus 800 ja rohkem. Klorofülli f sisaldavad taimed suudavad ellu jääda sügavamal ookeanis kui klorofülli d sisaldavad taimed, kuigi mõlemad klorofülli liigid vajavad päikesevalgust.
Geenitehnoloogia taimedest huvitatud teadlased püüavad leida moodust, kuidas panna tavalised põllumeeste põllukultuurid punast klorofülli tootma. Vee kohal neelab punane klorofüll teoreetiliselt palju rohkem päikesevalgust kui roheline klorofüll. Roheline klorofüll neelab siniseid ja lillasid valguskiiri nähtava valguse spektri lühikesel küljel, mis tähendab, et neelduvad kiired ei ole nii tugevad kui punane ja infrapunavalgus. Maismaataimed, mis on võimelised absorbeerima pikki ja tugevaid infrapunakiirte valgust, võivad olla võimelised fotosünteesima väga suure kiirusega, mis tähendab, et nad valmiksid ja saaksid väga kiiresti saaki.