Veterinaarmeditsiini maailmas on põhivaktsiinid vaktsiinid, mis on tungivalt soovitatavad ja mõnikord isegi nõutavad. Paljude loomade, sealhulgas koerte, kasside ja hobuste vaktsiiniprotokollid jagatakse tavaliselt põhi- ja mittepõhivaktsiinide vahel, et veterinaararstid saaksid tagada, et nende patsiendid saavad vajalikud vaktsiinid. Lemmikloomaomanikel on kasulik täpselt teada, et soovitatav vaktsiin on põhivaktsiin, kuna see rõhutab vaktsiini saamise tähtsust koos järelkontrolliga korduvate vaktsiinidega.
Kasside ja koerte puhul on marutaudi tõenäoliselt kõige levinum põhivaktsiin, sest marutaudi peetakse tõsiseks ohuks. Kasside puhul on kasside leukeemiaviirus (FeLV) veel üks levinud põhivaktsiin, eriti õues käivate kasside puhul. Sõltuvalt looma elukohast võib vaktsiiniplaani lisada ka teisi põhivaktsiine. Hobustel on sellised haigused nagu unetõbi, Lääne-Niiluse viirus ja teetanus tavaliselt kantud põhivaktsiinide nimekirja.
Seevastu mittepõhivaktsiinid on lihtsalt soovitatavad ja need ei pruugi kõigil juhtudel olla vajalikud. Tavaliselt kasutavad veterinaararstid professionaalsete ühenduste välja antud piirkondlikke juhiseid, et otsustada, milliseid vaktsiine manustada, ja nad võivad oma klientidega arutada mittepõhilisi võimalusi. Näiteks kui loom sööb palju, on soovitatav hankida bordetella (ka kennelköha) vastu mitte-põhiline vaktsiin, kuid kui loom viibib siseruumides ega lähe kunagi pardale, poleks bordetella vaktsiin vajalik.
Mõned maailma piirkonnad nõuavad konkreetselt, et loomad saaksid teatud põhivaktsiine. Kõige tavalisem nõutav vaktsiin on marutaudi vastu, kuna soovitakse kontrollida marutaudi esinemist kogu maailmas. Riikides, kus marutaudi ei esine, näiteks Suurbritannias, peavad kõik riiki sisenevad loomad kaasas kandma paberid, mis näitavad, et nad on saanud marutaudivaktsiini ja neid on testitud, et kinnitada antikehade olemasolu. Vaktsineerimisvõimaluste arutamisel veendub veterinaararst tavaliselt, et omanikud teavad, millised põhivaktsiinid on vajalikud ja millised on lihtsalt tungivalt soovitatavad.
Hinnates, millised põhivaktsiinid tuleks vaktsiinikavasse lisada, viivad ametnikud tavaliselt läbi tasuvusanalüüsi, et teha kindlaks, kas vaktsiinidest saadav kasu kaalub üles vaktsineerimise riski. Kuigi vaktsineerimine muutub pidevalt ohutumaks, kaasnevad nendega teatud terviseriskid ja see analüüs on koostatud seda arvesse võtma. Lemmikloomaomanikud peaksid alati teavitama vaktsiinide kõrvaltoimetest võimalikult kiiresti nii statistilistel põhjustel kui ka selleks, et anda ettevõtetele aega vaktsiinid tagasi kutsuda, kui nad leiavad, et palju on ohustatud.