Üle 80 protsendi kõigist USA-s müüdavatest pekanipähklitest on juba kooritud, sest paljude arvates on see kõige mugavam pähkli ostmise ja kasutamise viis. Need, kes ostavad koorega pekanipähklit, võivad vajada pekanipähkli koorikut, mis on seade, mis purustab pekanipähkli koore piisavalt, et sees olevale lihale ligi pääseks. Kommertstoimingutes on pekanipähklikoor masin, mis kasutab vibratsiooni, et eraldada pähkliliha koorest pärast seda, kui see on läbinud krakkimismasina.
Tarbijatele müüdavad pekanipähklikoored on arenenud pähklipurejad. Üks eriti tõhus pekanipähklikoore tüüp meenutab tangide paari, mis on varustatud kahe hambareaga. Pekanipähkli asetamine sellesse seadmesse ja surve avaldamine tekitab pekanipähkli kõvas kestas mitu vertikaalset lõhet. Pekanipähkli koore mõlema otsa purustamiseks võib kasutada ka kooriku hambaid, et eemaldada kogu kest. Kui mõlemad protseduurid on tehtud, pudeneb suurem osa pekanipähkli koorest maha, kuigi eemaldatav kate võib aidata pekanipähkli koore purustatud tükke hoida suletud alal, et aidata pärast koorimist puhastada.
Kaubandusliku koorimise rajatises on pekanipähkli koorimiseks vaja kahte masinat. Pekanipähkli kreeker lõikab pähkli pooleks, lüües mõlemat otsa korraga. Seejärel liigub pragunenud pekanipähkli kreekerist pekanipähkli koorikusse. See masin on tavaliselt mehaaniline või elektriline seade, mis vibreerib tugevalt purustatud pekanipähklit, et eraldada pähklid koorest.
Terved pekanipähklipoolikud nõuavad kõrgemaid jaehindu, nii et kaubanduslik pekanipähklikoor eemaldab ideaalselt kaks pekanipähklipoolikut koorest ilma neid purustamata. Kui välimine kest on eemaldatud, eraldab kaubanduslik kest ka pekanipähkli kahe poole vahelt kibedat puitu.
Pekanipähklite sees oleva pähkliliha kahjustamise võimaluse vähendamiseks töötlevad töötlejad neid enne purustamist ja koorimist. Selle saavutamiseks leotavad töötlejad sageli kogu pekanipähklit vee ja kloori lahuses. See on eelistatud konditsioneerimismeetod, kuna see võimaldab töötlejatel koristada rohkem terveid pähkleid. Tervete pekanipähklite auruga konditsioneerimine on võimalus, mis vähendab konditsioneerimiseks kuluvat aega. Seda meetodit kasutab aga vähem töötlejaid, kuna see annab pähklilihale ebaatraktiivse värvi.
Kui pekanipähklitöötlejad ja kodused pekanipähklite entusiastid saavad kasu, kui pekanipähklite koorimise seade aitab koorida, eelistavad mõned pekanipähklihuvilised lihtsamat meetodit. Koorisisese pekanipähkli käes pigistamine võib koore mõraneda, võimaldades pähkliliha välja noppida ilma mis tahes mehaanilise või muu abita. Samas nõuab protsess hoolt, sest liigne surve võib pähkliliha koos väliskestaga purustada ning muuta pingutuse masentavaks ja mõneti kasutuks.