Patogenees on haiguse areng alates haiguse algusest kuni selle lõppfaasini. Patogeneesi uurimine on meditsiinitöötajate jaoks oluline, kuna see aitab haigusi tuvastada ja ravida. See on ka osa haiguste ravi ja raviga tegelevate laboriteaduste tööst, kuna iga arenguetapp kujutab endast potentsiaalset võimalust haiguse progresseerumise katkestamiseks.
Mõiste “patogenees” pärineb kreekakeelsetest sõnadest “haigus” ja “algus”. Haiguse päritolu on patogeneesi esimene samm, nagu ka progresseeruvad muutused, mis toimuvad kehas, kui haigus haarab ja hakkab kehale mõjuma. Näiteks kui kedagi lõigatakse ja haava koloniseerivad Staphylococcus bakterid, põhjustavad bakterid levima hakates põletikku, mis lõpuks põhjustab infektsiooni. Iga samm lõikest kuni täieliku nakatumiseni on osa arengust.
Patogeneesi uurimiseks on mitmeid kasutusviise. Üksikute patsientide puhul võimaldab see arstil kindlaks teha, mis haiguse põhjustas ja kuidas haigust ravida. Suutlikkus tuvastada, millisesse staadiumisse haigus on jõudnud, võib olla oluline ka raviarsti jaoks, nagu onkoloogi puhul, kes soovib määrata vähi raskusastet.
Haiguste arengu uurimine võib anda ülevaate ka haiguste leviku viisidest ja potentsiaalselt aidata kaasa haiguse leviku aeglustamiseks mõeldud programmi väljatöötamisele. Näiteks ülaltoodud nakatunud lõikehaava näites võis nakatumist ära hoida regulaarne haava puhastamine antibakteriaalse seebiga – protseduur, mida kasutatakse nakkusohu vähendamiseks laialdaselt kodudes ja haiglates üle kogu maailma. See valdkond on ka uute ja esilekerkivate haiguste uurimise oluline osa, kuna nende haigustega ei saa tõhusalt võidelda, mõistmata, kust need pärinevad.
Mitmed meditsiinivaldkonnad ristuvad patogeneesiga, sealhulgas patofüsioloogia, mis uurib haiguse progresseerumisest organismis põhjustatud muutusi, ja epidemioloogia, mis uurib haiguste arengut ja liikumist populatsioonides. Haiguste arengu uurimine on eriti oluline meditsiinitöötajate jaoks, kuna see võimaldab neil astuda samme mitmesuguste haiguste ennetamiseks, diagnoosimiseks ja raviks. Paljud võhikud tunnevad teatud määral ka patogeneesi, näiteks inimesed, kes on kursis korduvate põsekoopapõletike progresseerumisega, või inimesed, kes pesevad käsi, et vähendada kokkupuudet haigusi põhjustada võivate ainetega.