Pahavara eemaldamine on protsess, mille käigus kustutatakse potentsiaalselt ründetarkvara, mis on salaja kõvakettale laaditud, kui arvutikasutaja külastab Internetis erinevaid saite. Kuigi paljud pahavara vormid ei tee muud, kui jälgivad Interneti-sirvimist ja kasutavad andmeid turunduskampaaniate väljatöötamiseks, on mõned vormid võimelised jäädvustama konfidentsiaalset teavet, näiteks krediitkaardinumbreid ja arvutioperaatori määratud sisselogimismandaate. Tänapäeval on saadaval mitmeid erinevaid pahavara eemaldajaid, millest paljud on tasuta.
Pahavara olemasolu tähendab, et süsteemiressursid suunatakse tarkvara vaikselt taustal käitamiseks. See võib põhjustada arvutil erinevate käskude täitmiseks rohkem aega. Äärmuslikel juhtudel võivad pahavara nõuded kahjustada tarkvara ja riistvara komponente, muutes need kasutuskõlbmatuks. Samuti on olemas pahavara ja viiruste kombinatsioonid, mis võivad rämpsposti saatmise eesmärgil kaaperdada meilikontosid, levitada nakatunud manuseid pahaaimamatutele kasutajatele ja isegi põhjustada arvutisüsteemi lukustumise ja täieliku tõrke.
Pahavara eemaldamiseks laaditakse tavaliselt kõvakettale uus tarkvara, mis suudab tuvastada pahavara komponente, neid analüüsida ja seejärel süsteemist kustutada. On mitmeid pahavara eemaldamise pakette, mida pakutakse tasuta. Kõik, mida lõppkasutaja peab tegema, on tarkvara alla laadida, skannida ja seejärel anda tarkvarale käsu eemaldada kõvakettalt leitud rikkuvad jälgimisseadmed ja muud tüüpi pahavara.
Tänapäeval pole ebatavaline leida süsteemipuhastustööriistu, mis eemaldavad pahavara koos nuhkvara ja arvutiviiruste eemaldamisega samal ajal. Seda tüüpi mitmeotstarbeliste süsteemipuhastusvahendite kasutamine välistab vajaduse süsteemi kaitseprotsessi osana alla laadida mitut erinevat tarkvarapaketti. Paljud neist mitmeotstarbelistest pahavara eemaldamisprogrammidest tühjendavad ka registrist kõik kahtlased kirjed ning eemaldavad troojalased ning erinevat tüüpi reklaam- ja nuhkvara.
Pärast laadimist võib pahavara eemaldamise tööriist taustal vaikselt töötada, et skannida sissetulevaid e-kirju ja blokeerida jälgimistarkvara automaatne allalaadimine erinevatelt veebisaitidelt. Mõned nuhkvara pahavara eemaldamise süsteemid on nakatumise vältimiseks konfigureeritud pidevalt töötama. Teised programmid on loodud nii, et lõppkasutaja neid aeg-ajalt juurutab, et kõvakettalt pahavara perioodiliselt kustutada.
Peaaegu iga pahavara eemaldamise tööriist vajab perioodilist värskendamist. Kuna iga päev töötatakse välja uusi nuhkvara, reklaamvara ja viiruste vorme, annab pahavara eemaldamise toote looja kasutajatele võimaluse värskendada programmi tuvastatud ja eemaldatavate pahatahtlike nakkuste kataloogi. Enamik tarkvarapakette võimaldavad automaatseid värskendusi, kui lõppkasutaja on Internetti sisse logitud, või julgustavad kasutajaid regulaarselt külastama pahavara eemaldamise toote kodulehte ja värskendusi käsitsi alla laadima.