Nahkhiirte kaitse on termin, mis kirjeldab asjaomaste isikute jõupingutusi, et aidata tugevdada ohustatud nahkhiirte populatsioone kogu maailmas. Ekspertide sõnul on nahkhiired ohustatud mitmel põhjusel, sealhulgas elupaikade hävitamise, pestitsiidide kasutamise ja haiguste tõttu. Nahkhiirte kaitsmiseks on inimesed teinud kõike, alates seaduste vastuvõtmisest oma elupaikade kaitseks, nahkhiirte populatsiooni ähvardavate ohtude uurimiseni kuni inimestele nahkhiirte õpetamiseni, et tekitada kaitsele avalikku toetust.
Maailmas on palju erinevaid nahkhiiri ja paljudel neist on täiesti erinev toitumine, mille tulemuseks on väga erinevad rollid ökosüsteemis. Näiteks paljud nahkhiired toimivad peamiselt putukate kiskjatena, samas kui teised võivad süüa puuvilju, teenides ökosüsteemi, levitades seemneid ja hoides metsi tervena. Enamikul juhtudel usuvad eksperdid, et kui nahkhiired välja surevad, ei saaks paljusid neist rollidest tingimata täita teised loomad, ja mõned eksperdid arvavad, et sellise sündmuse võimalikud tagajärjed võivad olla äärmiselt rasked. Mure nende ohtude pärast on üks peamisi liikumapanevaid jõude paljude nahkhiirte kaitsemeetmete taga.
Mõned nahkhiired elavad puudes, teised aga koobastes ja suurim oht nahkhiirtele on üldiselt elupaikade hävitamine. Mõnikord kahjustab elupaikade hävitamine nahkhiiri otse, hävitades nende elukohad, teistel juhtudel võib see olla kaudsem. Näiteks kui inimesed hävitavad sooalasid ja muid alasid, kus putukaid palju pesitseb, võib putukate populatsiooni vähenemine põhjustada nahkhiirte toidupuuduse. Probleemiks on ka see, et mõned koopas elavad nahkhiired elavad ka vanades hoonetes ja kui need hooned maha lõhutakse, kaotavad nahkhiired oma kodud. Mõnes piirkonnas on vastu võetud isegi nahkhiirte kaitseseadused, mis seavad piirangud kõigi hoonete hävitamisele, mida nahkhiired varjupaigana kasutavad, ning mõned inimesed rajavad oma isiklikule kinnistule väikesed nahkhiirte varjupaigad, et aidata nende elupaikade kadu korvata.
Teine suur oht nahkhiirtele on valge nina sündroomina tuntud seeninfektsioon ja paljud nahkhiirte kaitsemeetmed on pühendatud haiguse paremaks mõistmiseks. Valge nina sündroom põhjustab seente kasvu erinevates kehapiirkondades, sealhulgas suus, ning see võib põhjustada nahkhiirte pesadest lahkumist talveuneperioodil, mis viib lõpuks nälgimiseni ja surmani. Mõned eksperdid arvavad, et selle seene kiire leviku eest võivad peamiselt vastutada inimkoopad, kuigi see ei pruugi olla kindel. Mõned eksperdid on soovitanud inimestel koopaid vältida, kuni haigus on paremini mõistetav, samas kui teised on lihtsalt kutsunud inimesi üles mitte kunagi kandma samu riideid kahes erinevas koopas.