Märgalade kaitseprogramm kujutab endast vabatahtlikku valitsuse programmi, mille eesmärk on kaitsta ja säilitada märgalasid põllumajanduslikul eraomandil. Maaomanikud võivad anda maale eluaegse servituudi või servituudi, mis aegub kindlaksmääratud aja möödudes. Vastutasuks maksab valitsus maa kasutamise ja selle taastamise eest. Märgalade kaitseprogrammi eesmärkideks on puhkealade arendamine, kaladele ja elusloodusele elupaiga loomine, üleujutuste vältimine ja põhjaveevarude taastamine.
Haritav või looduslikus olekus maa võib olla märgalade kaitseprogrammi abikõlblik, sealhulgas karjamaa. Reservi moodustamiseks võib kaaluda ka alasid, mis muutuvad üleujutatud või kus põhjaveevarud on ammendunud. Programm võtab vastu ka olemasolevate märgaladega külgnevaid kinnistuid, mis võivad aidata kaasa piirkonna loodusvarade säilimisele.
Kinnisvaraomanikud, kes osalevad märgalade kaitseprogrammis, ei kaota maa omandiõigust. Nad võivad seda rentida jahipidamiseks, kalapüügiks, linnuvaatluseks või muuks vaba aja veetmiseks. Maaomanikud võivad taotleda ka muid heakskiidetud kasutusviise, näiteks puidu lõikamist maal või kariloomade karjatamist.
Maaomanikule tasumine sõltub antud servituudi liigist. Alalise servituudi puhul maksab valitsus kas põllumajandusvööndis oleva kinnisvara väärtuse, piirmäära või kinnisvaraomaniku taotletud summa. Kui antakse eluaegne servituut, maksab valitsus tavaliselt kogu taastamiskulud.
Kui on olemas 30-aastane rendileping, on maa ja taastamise eest tasumine kokku 75 protsenti, samas kui 10-aastased rendilepingud katavad vaid kolm neljandikku taastamiskuludest. Kaitserühmad abistavad tavaliselt maaomanikke kuludega, mida valitsusprogramm ei kata. Need rühmad töötavad tavaliselt kadunud märgalade taastamiseks. Püsiva või 30-aastase servituudi andmise korral võtab valitsus kinni registreerimis- ja hindamistasude, uuringute ja omandikindlustuse kogukulud.
Programmi eelised hõlmavad stiimuleid põllumajandustootjatele, kes ei saa üleujutuse tõttu oma maad kasutada. Märgalade taastamine parandab ka veekvaliteeti, filtreerides muda ja keemilisi ladestusi, ning suurendab kalade ja eluslooduse mitmekesisust. Mõned märgalad pakuvad alasid teadusuuringuteks, haridusvõimalusteks ja vaba aja veetmiseks.
Märgalade kaitseprogramm lisati USA 2002. aasta põllumajandusettevõtete turvalisuse ja maaelu investeerimise seadusesse. Seda haldab USA loodusvarade kaitse teenistus. Taotlused on saadaval USA põllumajandusministeeriumi kaudu.