Kolmas vatsake on üks neljast vedelikuga täidetud õõnsusest inimese aju vatsakeste süsteemis. See ulatub seljaaju keskkanalist ja on täidetud tserebrospinaalvedelikuga (CSF). Ülejäänud neli vatsakest koosnevad kahest külgvatsakesest ja neljandast vatsakesest. Üheskoos pakuvad need ajule kaitset ja stabiilsust. See muudab vatsakeste süsteemi oluliseks inimese närvisüsteemi nõuetekohaseks arenguks ja kasvuks.
Kolmas vatsake areneb samamoodi nagu ülejäänud vatsakeste süsteem — neuraaltoru keskkanalist. Täpsemalt, see vatsakese pärineb neuraaltoru osast, mis asub eesajus. Seda tuntakse ka prosentsefaloni nime all.
Kolmas vatsakese on kitsas õõnsus kahe külgvatsakese vahel vatsakeste süsteemis. Kolmas vatsake on sisuliselt aju keskjoone õõnsus, mis asub nägemisnärvi kiasmi, mugula tsinereumi, rinnakehade, infundibulumi, tagumise perforeeritud aine ja mesentsefaalse tegmentumi ülemise osa peal. Seda seovad ka mõlemal pool taalamus ja hüpotalamus. Kolmanda vatsakese katus koosneb ependüümikihist, mis on õhuke epiteelmembraani vooder.
Kolmandas vatsakeses on ka mitu väikest õõnsat ala või süvendit, mida nimetatakse süvenditeks. Optiline süvend asub optilise kiasmi tagaosas, kus nägemisnärvid lähevad üle ajju. Järgmisena on infundibulaarne süvend lehtrikujuline ala, mis ulatub infundibulumisse. Süvendisse kleepuvad rinnakehad põhjustavad kolmanda süvendi nimetuse rinnanäärme süvend. Lõpuks asub käbinääre süvend kolmanda vatsakese tagumises nurgas ja ulatub käbinäärmesse.
Ühendused nelja vatsakese vahel võimaldavad CSF-i voolu kolmanda vatsakese ja teiste vahel. See vatsakese eeskätt suhtleb külgvatsakestega interventrikulaarse ava kaudu. Samuti suhtleb see neljanda vatsakesega tagantpoolt ajuakvedukti kaudu, mida tuntakse ka Sylviuse akveduktina.
Ventrikulaarse süsteemi põhieesmärk on toota ja ringleda aju ümber CSF-i. See pehmendab aju ja seljaaju koljusisese kahjustuse eest. Ajupõrutus ehk verevalumid tekivad tugeva põrutuse ajal koljuga kokkupuutel. CSF pakub ka ujuvust, et toetada aju gravitatsiooni vastu ja tagada ujuv aju.