Enamik munasarjatsüstide tüüpe on kahjutud, kuid keerulised munasarjatsüstid kujutavad endast tegelikult ohtu naistele, kellel need tekivad. Selline tsüst võib põhjustada ebamugavust, ebaregulaarset verejooksu ja raseduse sümptomeid, nagu iiveldus ja rindade hellus. Tüüpiline kompleksne munasarjatsüst koosneb nii tahkest kui ka vedelast materjalist ning enamik neist vajab kontrolli all hoidmiseks operatsiooni või ravimeid. Kolm peamist tüüpi on dermoid, tsüstadenoomid ja endometrioom.
Tavaline tsüst, mida nimetatakse ka funktsionaalseks tsüstiks, tekib sageli menstruaaltsükli ajal ja sellel on vähe sümptomeid, kui üldse. Tavaliselt on funktsionaalse tsüsti halvim tulemus see, et see kasvab ja lõpuks väänab munasarja, põhjustades valu kõhus. Teisest küljest on keerulise munasarjatsüsti halvim võimalik tulemus surm, kuigi enamik neist põhjustab lihtsalt valu ja ebamugavaid sümptomeid, sealhulgas iiveldust, oksendamist, rindade tundlikkust, ebaregulaarset verejooksu ja äärmist vaagnavalu. Tegelikult kogevad mõned naised samu sümptomeid, mis sageli ilmnevad emakavälise raseduse või endometrioosi korral, mis mõlemad on teadaolevalt üsna valusad. Keerulised munasarjatsüstid on oluline viivitamatult arsti poolt üle vaadata, et veenduda, et need ei ole vähkkasvajad.
Üks kolmest peamisest komplekssete tsüstide tüübist on dermoidne tsüst, mis kasvab samadest rakkudest kui inimese munarakk. Seega on sellisel keerulisel munasarjatsüstil sageli inimese rakud, nagu juuksed, nahk või isegi hambad, ja kuigi see ei ole tavaliselt vähkkasvaja, on see tavaliselt valulik. Teine keeruline munasarjatsüst on endometrioom, mis esineb endometrioosi põdevatel inimestel. Seda leidub tavaliselt väljaspool emakat ja mõnikord põhjustab see probleeme munasarjadega, mistõttu on kiire ravi ülioluline. Tsüstadenoom sisaldab nii vedelikku kui ka lima ning võib kergesti ümber keerduda, mis tähendab, et see võib muutuda üsna valusaks.
Tavaliselt on keerulise munasarjatsüsti diagnoosimiseks vajalik vaagnapiirkonna uuring. Tegelikult kasutatakse seda tüüpi munasarjade massi diagnoosimiseks ja vähi või emakavälise raseduse puudumise kontrollimiseks sageli vaagnaelundite ultraheli, vereanalüüsi ja rasedustesti. Paljudel juhtudel on operatsioon parim ravivõimalus, eriti kui tsüst näib olevat suur või kasvab. Seda saab teha laparoskoopia abil, mis hõlmab mitme väikese sisselõike tegemist ja seejärel leitud tsüstide eemaldamist. Valuvaigisteid võib anda ka selleks, et kontrollida ebamugavust, mis tavaliselt kaasneb keerulise munasarjatsüstiga.