Inimestel koosneb peensool tavaliselt kolmest osast; esimene, kui toit maost väljub, on kaksteistsõrmiksool. Tühisool ja niudesool on muud osad, mida tavaliselt eristavad trakti sisemust vooderdavad rakutüübid. See esimene sektsioon on torutaoline struktuur, mis on tavaliselt 9.8–11.8 tolli (25–30 sentimeetrit) pikk. Tavaliselt koosneb see mitmest kihist. Kaksteistsõrmiksoole histoloogiat iseloomustavad ka mikroskoopilised struktuurid, mida nimetatakse Brunneri näärmeteks ja mis võivad eritada maohappeid neutraliseerivat lima.
Toit siseneb elundisse sageli kuni neli tundi pärast söömist. Väikesed kanalid võivad võimaldada pankrease ensüümide ja sapi sissevoolu, mis samuti neutraliseerivad happeid ja aitavad kaasa seedimisele. Kaksteistsõrmiksoole histoloogia esindab tavaliselt volditud struktuuri, eriti limaskesta kihis, mis koosneb tavaliselt ringikujulistest või põiksuunalistest voldikutest. Samuti on väljaulatuvad osad, mida nimetatakse villideks ja mille pikkus on kuni 0.04 tolli (1 millimeeter). Nende keskmes on lümf ja veresooned ning närvid.
Tavaliselt on villi sees mikroskoopiline kiht, mida nimetatakse harjapiiriks ja mis koosneb karvalaadsetest rakkude osadest, mida nimetatakse mikrovillideks. Samuti on pokaalrakud, mis eritavad lima, et aidata toidul läbi toru läbida. Mikrovoldirakud moodustavad ka kaksteistsõrmiksoole histoloogia; nad toimivad tavaliselt antigeenide esitlemisega ja vooderdavad lümfisõlmede seeriat. Rakke, mida nimetatakse lümfotsüütideks, leidub sageli sügavamas kihis, mida nimetatakse lamina propriaks ja mis koosneb samuti sidekoest. Lümfisüsteemid võivad koonduda teatud piirkondadesse, samas leidub ka selles kihis soolestikule omaseid näärmeid.
Soolenäärmed, mida nimetatakse Liberkuhni krüptideks, on üldiselt torukujulised ja kaksteistsõrmiksoole sisepinnal avatud. Tavaliselt on ka limaskesta ja muid endokriinseid sekretsiooni rakke. Submukoosne kiht on tavaliselt Brunneri näärmete asukoht, mida leidub ainult kaksteistsõrmiksoole histoloogias. Tavaliselt identifitseeritakse keerdunud, hargnenud torukujulise kuju järgi, need on vooderdatud lima sekreteerivate rakkudega ja tavaliselt on need ühendatud kanalitega, mis viivad soolenäärmeteni.
Ringikujuline kiht ja pikisuunaline lihaskiht moodustavad tavaliselt olulise osa kaksteistsõrmiksoole histoloogiast, mida nimetatakse musculariks. Välimine kiht on tüüpiline kogu peensooles leiduvale kihile, samas kui seroos moodustab üldiselt kaksteistsõrmiksoole välimise osa. See kiht on ka kõhukelme ehk kõhuorganeid ümbritseva koe komponent.