Ivermektiin hobustele on üks tõhusamaid meetodeid parasiitide raviks ja ennetamiseks. Ravim võitleb 35 erineva parasiitorganismiga, sealhulgas strongyles, mitut tüüpi ussid ja robotid. Ussid, mida see ravida ja tõrjuda saab, on ussid, kopsuussid ja soolestiku karvaussid. Seda peetakse ohutuks kasutamiseks kõigil hobustel, kuigi tootjad soovitavad seda mitte kasutada toiduks mõeldud loomadel. Ivermektiin halvab parasiitide neurotransmitteri gamma-aminovõihappe (GABA). See hape on ainulaadne parasiitorganismidele ja seetõttu ei mõjuta tüüpiline ivermektiini annus selgroogseid, näiteks hobuseid. See võib ära hoida uusi parasiitinfektsioone ja hävitada ka aktiivseid infektsioone.
Omanikud saavad osta hobustele mõeldud ivermektiini pasta kujul. Seda müüakse sageli plastsüstlas, mis sisaldab piisavalt ravimit ühe või mitme täiskasvanud hobuse jaoks. Ravimi manustamiseks tuleb süstla ots viia hobuse suhu. Seejärel süstitakse pasta looma keele tagaküljele. Sageli soovitatakse omanikel hoida hobuse pead püsti, et ta ei saaks ravimit välja sülitada. Ivermektiini kasutamisel hobustel peetakse üleannustamist väga raskeks. On teada, et loomad söövad alla kuni üheksa korda soovitatud annusest ilma kõrvaltoimeteta. Ivermektiini manustamist parasiitide tõrjeks võib alustada siis, kui hobune on kuue kuni kaheksa nädala vanune.
Ravim on parasiitide tõrjel nii tõhus, et veterinaararstid soovitavad sageli selle aeg-ajalt mõne muu ravitüübi vastu välja vahetada. Mure seisneb selles, et parasiidid tekitavad lõpuks hobustel ivermektiini suhtes resistentsuse, mis muudab selle ebatõhusaks. Samal ajal hoiatavad loomaarstid ussirohtude liiga sagedase pöörlemise eest ja väidavad, et see võib põhjustada parasiitide resistentsuse väljakujunemist mitme ravimi suhtes korraga. Soovitatav on teha hobustele ussitõrjeprogrammi manustamisel tihedat koostööd loomaarstiga.
Ivermektiini kasutamine hobustel on aeg-ajalt teadaolevalt põhjustanud kõrvaltoimeid. Mõnedel hobustel on pärast kaelaussi mikrofilaaria vastu ivermektiinravi tekkinud turset ja sügelust. Arvatakse, et reaktsioonid olid tingitud suurest arvust mikrofilaariatest, mis surid korraga välja. Ivermektiini peetakse hobustele äärmiselt ohutuks, kuid inimesi hoiatatakse pärast ravimi käsitsemist käsi pesema. Kasutatud ivermektiini süstlaid ei tohi visata veeallikasse, kuna see võib vees olevaid selgrootuid kahjustada või tappa.