Hermafrodiit kirjeldab inimest, kes on sündinud nii naise kui ka mehe kehaliste omadustega. Siiski on interseksuaalsus muutumas üha populaarsemaks kirjelduseks, kui viidatakse selle kaasasündinud seisundiga isikutele. Hermafrodiit võib sündida mõlema suguelundiga või ühe peamise suguelundiga, kuid tal võib olla osa teisest vastasorganist. Lisaks nähtavatele tunnustele võivad inimese intersooliseks määratlemist põhjustada ka muud füüsilised omadused, näiteks kromosomaalsed erinevused, mis ilmnevad Klinefelteri sündroomi korral, kus mees sünnib kahe X-kromosoomi ja ühe Y-kromosoomiga.
Hermafrodiidi märgistust ei kasutata mitte ainult inimeste puhul, vaid seda kasutatakse sageli ka teatud taimeliikide ja ka teiste mõlemat suguelundit omavate loomade kirjeldamiseks. Ajalooliselt on selle haigusseisundiga sündinud inimesed sageli läbinud operatsiooni imikueas. Kõigil eesmärkidel on operatsioon ette nähtud ühe suguorgani eemaldamiseks ja seega lapse anatoomiliseks muutmiseks naiseks või meheks.
Mõned, näiteks Põhja-Ameerika Interseksuaalide Ühing, peavad hermafrodiiti intersooliste isikute aegunud ja ebatäpseks kirjelduseks. Tavaliselt kasutatakse seda inimeste kirjeldamiseks, kes arvatakse olevat füüsiliselt nii naised kui ka mehed. Inimesi, kes on sündinud mõlemast soost iseloomustavate tunnustega, ei saa aga nii lihtsalt kujutada kui täiesti naissoost, olles samal ajal täiesti mehed. Täpsemalt, inimene, keda mõned võivad nimetada hermafrodiidiks, võib tegelikult sündida väliselt meheliku välimusega, kuid tal on naiselikud siseorganid või vastupidi.
On mitmeid teisi kaasasündinud variatsioone, mis panevad mõned hermafrodiidi märgist kõrvale hoidma. Näiteks võib vastsündinud tüdruk sündida ilma tupe avanemiseta või võib sündida suurenenud kliitoriga, mis võib tunduda väikese peenisena. Vastsündinud poisil võib sündida häbememokkade kujuline munandikott.
Teist kirjeldust, mis kunagi määratleti tõelise hermafrodiidina, rakendatakse isikute kohta, kellel on sugunäärmed, mis koosnevad nii munandi- kui ka munasarjakoest. Tänapäeval nimetavad arstid seda interseksuaalset seisundit sagedamini munanditeks. Mõnel inimesel võib olla kaks munarakku või ainult üks, mis on seotud mõne teise munasarjaga. Muna munanditega sündinud imikutel näivad sageli olevat normaalse välimusega naiste või meeste suguelundid, samas kui mõnel on suguelundid, mis näivad olevat mõlema kombinatsioon.
Arstiteadus on avastanud, et isikud, keda võidi kunagi kirjeldatud kui hermafrodiiti, võivad tegelikult sündida mitmete naiste ja meeste suguelundite variatsioonidega. See on viinud termini interseksuaalsuse levinuma kasutamiseni, millega selliseid isikuid tänapäeval märgistatakse. Mõned selle seisundiga sündinud inimesed on siiski otsustanud endise märgistuse omaks võtta, samas kui teised leiavad, et see on solvav.